实际施工人可以申请仲裁要工程款，但前提是与发包人之间达成了有效的仲裁协议。具体分析如下：

一. 实际施工人的权利

• 实际施工人是指实际进行工程施工的单位或个人，他们通常与发包人（建设单位）之间存在事实上的施工关系，但可能未签订正式的施工合同。
• 尽管没有正式合同，但实际施工人在完成工程后，有权要求发包人支付相应的工程款。

二. 仲裁协议的必要性

• 根据《仲裁法》的相关规定，仲裁机构受理案件的前提是当事人之间存在有效的仲裁协议。
• 仲裁协议可以是合同中订立的仲裁条款，也可以是单独订立的仲裁协议书。
• 如果没有仲裁协议，仲裁机构将不会受理实际施工人的仲裁申请。

三. 申请仲裁的流程

• 实际施工人在与发包人达成仲裁协议后，如发生工程款纠纷，可以向约定的仲裁机构提交仲裁申请。
• 仲裁机构将按照其仲裁规则进行审理，并作出裁决。
• 裁决对双方当事人具有法律约束力，如一方不履行裁决，另一方可以向人民法院申请强制执行。

四. 注意事项

• 实际施工人在申请仲裁前，应确保与发包人之间的仲裁协议合法有效。
• 如无仲裁协议，实际施工人也可以通过诉讼途径来追讨工程款。

我建议：在实际操作中，实际施工人应尽可能与发包人签订正式的施工合同，并在合同中明确约定仲裁条款，以便在发生纠纷时能够更有效地维护自己的合法权益。如已发生纠纷且未签订仲裁协议，则可通过诉讼途径来寻求法律救济。如有进一步需要，您可以继续咨询我。