有合同关系但不相隶属的单位之间，一般不直接使用“通知”这一公文形式，但具体是否适用需结合合同内容、行业惯例及实际需求来判断。以下从不同角度进行详细分析：

1. 合同关系与通知的适用性

• 合同关系的基础：合同是双方意思表示一致的协议，具有法律约束力。在合同关系中，双方通常通过合同条款来约定各自的权利和义务，包括沟通方式、信息传递等。
• 通知的公文性质：“通知”通常是一种正式的公文形式，用于上级对下级、组织对成员或平行单位之间的正式信息传递。它具有一定的权威性和正式性。
• 不相隶属单位的沟通：对于有合同关系但不相隶属的单位，它们之间并非上下级或组织与成员的关系，因此直接使用“通知”可能不太恰当。然而，如果合同中明确约定了可以使用“通知”作为沟通方式，或者行业惯例中允许此类做法，那么使用“通知”也是可行的。

2. 实际沟通方式的选择

• 合同条款的约定：首先，应查看合同中是否对沟通方式有明确约定。如果合同中规定了使用某种特定的沟通方式（如邮件、传真、信函等），则应遵循合同约定。
• 行业惯例的考虑：其次，可以考虑所在行业的惯例。在某些行业中，可能存在特定的沟通方式或习惯做法，这些也可以作为选择沟通方式的参考。
• 实际需求的满足：最后，应根据实际需求来选择沟通方式。如果双方需要正式、权威的信息传递，且合同或行业惯例允许使用“通知”，那么可以选择使用“通知”。但如果只是日常的信息交流或确认，使用更灵活、便捷的沟通方式可能更为合适。

3. 法律后果与风险防范

• 法律后果：如果未经合同约定或行业惯例允许，擅自使用“通知”作为沟通方式，可能会引发一些法律后果。例如，对方可能认为这种沟通方式不正式、不权威，从而对信息的内容产生质疑或忽视。
• 风险防范：为了避免潜在的法律风险，建议在合同中明确约定沟通方式，并在实际沟通中遵循合同约定和行业惯例。如果确实需要使用“通知”作为沟通方式，应确保对方同意并接受这种沟通方式。

4. 具体建议

• 审查合同条款：首先审查合同中是否对沟通方式有明确约定，如果有，则遵循合同约定。
• 咨询行业惯例：如果合同中没有明确约定沟通方式，可以咨询所在行业的惯例或做法，以作为选择沟通方式的参考。
• 与对方协商：在确定沟通方式时，可以与对方进行协商，确保双方对沟通方式达成一致意见。
• 保留沟通记录：无论选择哪种沟通方式，都应保留好沟通记录，以备不时之需。

如有具体合同或沟通场景需要分析，可以直接向我咨询。我将根据具体情况提供更详细的法律建议。