针对小包工头亏本后，公司直接将工程款支付给工人但仍不足的情况，可以从以下几个角度进行分析和提出建议：
工人角度：
- 协商与沟通：工人首先可以尝试与包工头进行进一步的协商，了解其亏本的具体原因和财务状况，看是否能够达成一个双方都能接受的支付方案。同时，工人也可以向包工头表达自己的困难和需求，争取其理解和支持。
- 法律维权：若协商无果，工人有权向劳动监察部门投诉。根据《劳动保障监察条例》，劳动监察部门有权责令包工头支付工资，并对其进行相应的处罚。此外，工人还可以申请劳动仲裁，通过法律途径确定工资数额和支付方式。若包工头不履行仲裁结果，工人可以向法院申请强制执行其财产。
- 要求垫付：如果工程建设单位或总承包单位存在未结清工程款的情况，根据相关规定，工人有权要求其在未结清工程款范围内先行垫付工资。
包工头角度：
- 积极沟通：包工头应主动与工人沟通，说明自己亏本的原因和财务状况，争取工人的理解和支持。同时，包工头也应积极寻求解决方案，如与建设单位或总承包单位协商，争取尽快结清工程款。
- 法律责任：包工头应明确自己的法律责任，即按时足额支付工人工资。若因亏本等原因无法支付，包工头应积极采取措施筹集资金，或与工人协商分期支付等方案，以避免法律纠纷。
公司（建设单位或总承包单位）角度：
- 合规操作：公司在支付工程款时，应确保合规操作，避免直接将工程款支付给工人而引发纠纷。若确实需要直接支付给工人，公司应与包工头和工人进行充分沟通，并确保支付金额和方式符合法律规定和合同约定。
- 垫付责任：若公司存在未结清工程款的情况，且包工头因亏本等原因无法支付工人工资，公司应根据相关规定，在未结清工程款范围内先行垫付工资。这是公司的法律责任，也是维护工人权益和社会稳定的重要举措。
在处理此类纠纷时，还需注意以下几点法律背景和建议：
- 工人应保留好与包工头的劳动合同、工资条等证据，以便在维权时提供有力支持。
- 包工头应遵守相关法律法规和合同约定，按时足额支付工人工资。若因特殊原因无法支付，应及时与工人沟通并寻求解决方案。
- 公司应加强对工程款支付的管理和监督，确保合规操作并避免引发纠纷。同时，公司也应积极履行社会责任，维护工人权益和社会稳定。
若遇到此类问题，建议各方保持冷静和理性，通过协商、法律途径等方式妥善解决纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。