事业编因病瘫痪员工距离退休还有三年，单位让做劳动能力鉴定是合法的。以下从多个角度为您详细分析：

合法性依据

根据人力资源社会保障部、国家卫生健康委员会、国家医疗保障局联合发布的《关于进一步规范劳动能力鉴定工作的通知》（人社部发〔2020〕91号），劳动能力鉴定是职工享受相关社保待遇的重要依据，也是防范基金风险的重要环节。对于未达到法定退休年龄因病或非因工致残完全丧失劳动能力的职工，人社部门在办理退休时，应当以劳动能力鉴定委员会出具的鉴定结论为依据。因此，单位要求因病瘫痪的员工进行劳动能力鉴定，是符合相关政策规定的。

劳动能力鉴定的目的和意义

1. 确定劳动能力丧失程度：通过劳动能力鉴定，可以科学、客观地评估员工因病导致的劳动能力丧失程度，为后续的社保待遇享受提供依据。
2. 保障员工权益：劳动能力鉴定结果直接关系到员工能否享受相应的社保待遇，如残疾津贴、一次性伤残补助金等。因此，进行劳动能力鉴定有助于保障员工的合法权益。
3. 规范单位管理：单位要求员工进行劳动能力鉴定，也是履行管理职责、规范用工行为的表现。这有助于单位更好地了解员工的身体状况，合理安排工作岗位和任务。

员工应如何应对

1. 积极配合：员工应理解单位的合理要求，积极配合进行劳动能力鉴定。这有助于维护自身的合法权益，也有助于单位更好地管理用工关系。
2. 了解鉴定流程：员工可以提前了解劳动能力鉴定的流程、标准和所需材料，以便更好地准备和参与鉴定。
3. 咨询专业人士：如果在鉴定过程中遇到任何问题或疑虑，员工可以咨询专业的律师或社保机构，以获取更准确的指导和帮助。

可能的法律后果

如果员工拒绝进行劳动能力鉴定，可能会面临以下法律后果：

1. 影响社保待遇享受：没有劳动能力鉴定结论，员工可能无法享受相应的社保待遇，如残疾津贴、一次性伤残补助金等。
2. 单位管理困难：员工拒绝鉴定可能导致单位在管理上遇到困难，如无法合理安排工作岗位和任务等。
3. 法律责任：在极端情况下，如果员工因拒绝鉴定而导致单位遭受损失，员工可能需要承担相应的法律责任。

建议：作为事业编因病瘫痪的员工，您应积极配合单位的要求进行劳动能力鉴定。这不仅有助于维护自身的合法权益，也有助于单位更好地管理用工关系。如果您在鉴定过程中遇到任何问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律指导和帮助。