结论前置：对于职业禁忌症女员工调岗后被公司以超过50岁达到退休年龄为由辞退是否合法的问题，需分情况讨论。若该女员工已达到法定退休年龄并开始依法享受基本养老保险待遇，则公司辞退合法；若未达到法定退休条件或未开始享受基本养老保险待遇，则公司辞退可能不合法。
一、合法辞退的情况
达到法定退休年龄：
- 对于女工人而言，法定退休年龄为50周岁。若该女员工已年满50周岁，且已开始依法享受基本养老保险待遇，那么根据《劳动合同法》及其实施条例的规定，劳动合同自然终止，公司辞退该员工是合法的，且无需支付经济补偿。
存在过错性辞退情形：
- 即使女员工未达到法定退休年龄，但如果她存在严重违反用人单位规章制度、严重失职给用人单位造成重大损害等过错性情形，公司依据《劳动合同法》的规定辞退她也是合法的。不过，这种情况与年龄和退休无关，而是基于员工的过错行为。
二、不合法辞退的情况
未达到法定退休条件：
- 若该女员工虽年满50岁，但未达到法定退休条件（如未缴纳足够年限的社会保险），未开始依法享受基本养老保险待遇，那么公司仅以年龄超过50岁为由辞退她可能是不合法的。此时，若公司无正当理由辞退员工，属于违法解除劳动合同，员工有权要求公司继续履行劳动合同或支付赔偿金。
职业禁忌症与调岗的关联性：
- 女员工因职业禁忌症被调岗，这本身并不构成公司辞退她的合法理由。除非调岗后员工仍无法胜任工作，且公司已按照法律规定进行了培训或调整工作岗位等程序，否则公司不能仅凭调岗就辞退员工。
三、经济补偿与赔偿
经济补偿：
- 若公司合法辞退员工（如达到法定退休年龄），则无需支付经济补偿。但若公司违法辞退员工（如无正当理由辞退未达到退休年龄的员工），则员工有权要求公司按照经济补偿标准的二倍支付赔偿金。
赔偿金计算：
- 经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。若员工的月工资高于当地上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，且向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。赔偿金则是经济补偿标准的二倍。
四、法律建议
- 对于员工：若认为自己被公司违法辞退，应及时收集相关证据（如劳动合同、辞退通知、工资流水等），通过劳动仲裁或诉讼等法律途径维护自己的合法权益。
- 对于公司：在辞退员工时应严格遵守法律法规，确保辞退行为的合法性。特别是对于接近退休年龄或存在特殊情况的员工，更应谨慎处理，避免不必要的法律风险。
有问题可以直接向我咨询，我会结合你的具体情况给出更详细的法律建议。