辞退有职业禁忌症且年龄超过50周岁的女员工是否合法，需依据具体情形来判断。以下从不同角度进行分析：

一、若女员工已达法定退休年龄且享受养老保险待遇

根据《劳动合同法》的相关规定，当女员工达到法定退休年龄（通常为50岁，具体以当地政策为准）并开始依法享受基本养老保险待遇时，劳动合同依法终止。在此情况下，公司终止劳动关系不属于辞退情形，因此是合法的，且无需支付经济补偿金。

二、若女员工未达法定退休年龄或未享受养老保险待遇

1. 存在合法辞退情形：

   • 若女员工存在严重违反用人单位规章制度、严重失职或营私舞弊给用人单位造成重大损害、同时与其他用人单位建立劳动关系且对完成本单位工作任务造成严重影响且经用人单位提出拒不改正等情形，公司有权依法解除劳动合同，且无需支付经济补偿金。
   • 若女员工因患病或非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作，且经培训或调岗后仍不能胜任，公司提前三十日以书面形式通知或额外支付一个月工资后，可以解除劳动合同，但需支付经济补偿金。

2. 不存在合法辞退情形：

   • 若女员工虽年龄超过50岁但未达法定退休年龄，或虽达法定退休年龄但未享受养老保险待遇，且不存在上述合法辞退情形，公司无正当理由辞退女员工则属于违法解除劳动合同。
   • 在此情况下，女员工有权要求公司继续履行劳动合同，或要求公司支付违法解除劳动合同的赔偿金。赔偿金标准为经济补偿标准的二倍，经济补偿按女员工在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向其支付。工作六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。

三、针对职业禁忌症的特殊考虑

• 若女员工因职业禁忌症无法从事原工作，公司应首先考虑调整其工作岗位，以适应其健康状况。
• 若调整工作岗位后，女员工仍无法胜任工作，且不存在其他合法辞退情形，公司应依法支付经济补偿金后解除劳动合同，而非直接辞退。

建议：

• 对于公司而言，在辞退员工前应仔细审查辞退理由是否合法，避免违法解除劳动合同带来的法律风险。
• 对于女员工而言，若认为公司辞退行为违法，有权要求公司支付违法解除劳动合同的赔偿金，并可先与公司协商，协商不成可通过劳动仲裁或诉讼等法律途径维护自身权益。

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