事业单位改革中规定5年不让转岗是否合法，不能一概而论，需结合具体情况和地方规定来判断。以下从不同角度进行分析：
一、地方性规定的影响
特定地区的规定：以新疆为例，根据《新疆维吾尔自治区事业单位岗位聘用管理办法(试行)》的规定，跨岗位类别转岗的事业单位工作人员，在签署转岗承诺书后，原则上5年内不得再次提出转岗申请。这一规定是地方性政策，旨在完善事业单位岗位聘用管理制度。因此，如果所在地区有类似的地方性规定，并且该规定不违反上位法，那么事业单位按照此规定执行5年不让转岗是合法的。
无地方性规定的情况：如果所在地区没有明确的5年不让转岗的规定，那么事业单位自行设定这样的限制可能缺乏法律依据。在这种情况下，事业单位的限制可能构成对员工权益的不当限制，员工有权提出异议。
二、法律法规的考量
劳动合同法的规定：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者应当按照劳动合同的约定，全面履行各自的义务。如果劳动合同中没有关于转岗限制的明确约定，或者约定违反法律法规的强制性规定，那么事业单位单方面设定的5年不让转岗的限制可能无效。
员工权益的保护：员工在事业单位工作期间，享有合法的劳动权益，包括但不限于获得劳动报酬、享受社会保险和福利待遇、参与民主管理等。如果5年不让转岗的规定严重损害了员工的合法权益，员工可以通过法律途径维护自己的权益。
三、建议与措施
查阅地方性规定：首先，建议您查阅所在地区关于事业单位岗位聘用的地方性规定，了解是否有关于转岗限制的具体条款。
与单位协商：如果认为5年不让转岗的规定不合理或违反法律法规，您可以与单位进行协商，寻求合理的解决方案。
寻求法律援助：如果协商无果，您可以咨询专业律师或向劳动争议仲裁机构申请仲裁，以维护自己的合法权益。
举例说明：假设您在新疆某事业单位工作，根据《新疆维吾尔自治区事业单位岗位聘用管理办法(试行)》的规定，您在跨岗位类别转岗后签署了转岗承诺书，并接受了5年内不得再次转岗的限制。这一规定在新疆地区是合法的，因为它是地方性政策的一部分。然而，如果您在另一个没有此类规定的地区工作，事业单位自行设定的5年不让转岗的限制可能就不具备法律效力。
总结来看，事业单位改革中5年不让转岗的规定是否合法，取决于所在地区是否有明确的地方性规定以及该规定是否违反上位法。在遇到此类问题时，建议您先查阅相关规定，再与单位协商或寻求法律援助。如果您有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。