公司通过自己开发的软件发放工资，这一行为本身并不违法，但必须满足一系列条件以确保合法性和合规性。以下是从不同角度进行的详细分析：

一、软件支付功能的要求

1. 合法性与安全性：公司使用的软件必须具备合法、安全的支付功能。这意味着软件需要符合相关的金融安全标准，能够确保工资准确、及时地发放到员工账户中，避免出现支付错误或延迟。
2. 员工权益保障：软件应提供员工查询工资详情的途径，确保员工能够随时了解自己的工资构成、扣减项目等关键信息。这是保障员工知情权的重要一环。

二、劳动合同与支付周期

1. 劳动合同约定：根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，公司应按照劳动合同约定的薪资和支付周期全额支付工资。这意味着，无论采用何种支付方式，公司都必须遵守与员工签订的劳动合同中的相关条款。
2. 支付周期合规性：工资支付周期应符合法律法规的规定，如按月支付等。公司不得通过软件支付方式变相延长支付周期或克扣工资。

三、财经法规与税务准则

1. 财经法规遵守：公司在使用软件发放工资时，必须遵守相关的财经法规，确保工资支付的合法性和合规性。这包括但不限于资金来源的合法性、支付流程的规范性等。
2. 税务准则履行：公司应如实履行纳税义务，按照税法规定代扣代缴个人所得税等税费。软件支付方式不应成为公司逃避税务责任的手段。

四、违法行为的法律后果

1. 违法行为界定：如果公司通过软件发放工资来规避劳动法规或财税政策，如虚报工资金额、克扣薪酬等，则构成违法行为。这些行为不仅损害了员工的合法权益，也破坏了市场的公平竞争环境。
2. 法律责任承担：对于违法行为，公司将面临法律责任的追究。这可能包括罚款、补缴税款、支付赔偿金等民事责任，以及在严重情况下可能承担的刑事责任。

五、建议与注意事项

1. 完善软件功能：公司在使用自己开发的软件发放工资前，应确保软件具备完善的功能，包括支付、查询、统计等，以满足法律法规和员工权益保障的要求。
2. 加强内部管理：公司应建立健全的内部管理制度，规范工资支付流程，确保工资支付的准确性和及时性。同时，应加强对员工的培训和宣传，提高员工对软件支付方式的认知度和接受度。
3. 定期审计与检查：公司应定期对软件支付方式进行审计和检查，确保支付过程的合规性和安全性。对于发现的问题和隐患，应及时进行整改和纠正。

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