结论是：厂里辞职但劳务派遣未辞职而扣工资的行为，通常是违法的。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律角度
劳动合同关系：
- 您与劳务派遣公司签订了劳动合同，形成了劳动关系。根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位（即劳务派遣公司）应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
- 如果劳务派遣公司因您未在其处办理辞职手续而扣工资，这违反了劳动合同的约定和法律规定，因为工资支付与辞职手续的办理是两个独立的法律关系。
工资支付义务：
- 劳务派遣公司作为用人单位，有义务按时足额支付您的工资，无论您是否在厂里办理了辞职手续。工资是您提供劳动后应得的报酬，与辞职手续的办理无直接关联。
二、实际操作角度
辞职流程：
- 通常情况下，辞职应遵循一定的流程，包括向直接用人单位（厂里）和劳务派遣公司提出辞职申请，并办理相关离职手续。然而，这并不意味着如果未在劳务派遣公司办理辞职手续，就可以扣工资。
- 如果您已经向厂里提出了辞职，并且厂里已经接受了您的辞职申请，那么劳务派遣公司无权因您未在其处办理辞职手续而扣工资。
沟通协商：
- 如果出现这种情况，建议您首先与劳务派遣公司进行沟通协商，明确告知其扣工资的行为是违法的，并要求其立即停止违法行为并补发工资。
- 如果沟通协商无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
三、可能后果
法律责任：
- 如果劳务派遣公司坚持扣工资，且经劳动监察部门或劳动仲裁机构认定其行为违法，那么劳务派遣公司可能需要承担法律责任，包括补发工资、支付赔偿金等。
信用影响：
- 劳务派遣公司的违法行为还可能对其信用记录产生不良影响，进而影响其未来的业务发展和市场竞争力。
建议：
- 保留好与劳务派遣公司的劳动合同、工资条、辞职申请等相关证据，以备不时之需。
- 如果与劳务派遣公司沟通协商无果，及时向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 在整个过程中，保持冷静和理性，依法维护自己的合法权益。
如果您还有其他关于劳动工伤或劳务派遣方面的问题，可以直接向我咨询。