单位值夜班期间跑步骨折，一般不能直接认定为工伤。以下从工伤认定的法律依据、具体情形分析以及建议措施三个方面进行详细阐述：

一、工伤认定的法律依据

根据《工伤保险条例》第十四条，职工在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害的，应当认定为工伤。同时，该条例还列举了其他几种应当认定为工伤的情形，如工作时间前后在工作场所内，从事与工作有关的预备性或者收尾性工作受到事故伤害的；在工作时间和工作场所内，因履行工作职责受到暴力等意外伤害的；患职业病的；因工外出期间，由于工作原因受到伤害或者发生事故下落不明的；在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故或者城市轨道交通、客运轮渡、火车事故伤害的等。

二、具体情形分析

1. 跑步行为与工作任务的关联性：

   • 若跑步是单位组织的活动，或者与工作任务有直接关联（如保安巡逻时的跑步），则可能被视为工作原因，从而有可能认定为工伤。
   • 若跑步纯粹是个人行为，与工作任务无直接关联，则一般不被视为工作原因，因此不能认定为工伤。

2. 骨折的因果关系：

   • 即使跑步行为与工作任务有一定关联，也需要证明骨折是由跑步行为直接导致的，而非其他个人原因（如个人健康状况、意外事件等）。

3. 单位规章制度与劳动合同：

   • 还需考虑单位是否有相关规章制度禁止或限制员工在工作时间内进行跑步等个人活动，以及劳动合同中是否有相关约定。

三、建议措施

1. 及时报告与就医：

   • 发生骨折后，应立即向单位报告，并尽快就医治疗。同时，保留好相关医疗证明和费用单据。

2. 申请工伤认定：

   • 若认为符合工伤认定条件，可向单位提出工伤认定申请。单位应在规定时间内向社会保险行政部门提出工伤认定申请。若单位未提出申请，员工或其近亲属、工会组织也可在规定时间内直接提出申请。

3. 准备相关证据：

   • 在申请工伤认定时，需准备相关证据证明骨折与工作任务的关联性，如单位组织的活动通知、工作任务安排、同事证言等。

4. 寻求法律帮助：

   • 若对工伤认定结果有异议，或单位不配合申请工伤认定，可寻求法律帮助，通过法律途径维护自身权益。

总结来看，单位值夜班期间跑步骨折能否认定为工伤，需根据具体情况进行判断。若跑步行为与工作任务有直接关联，且骨折是由跑步行为直接导致的，同时符合其他工伤认定条件，则有可能被认定为工伤。否则，一般不能认定为工伤。在处理此类问题时，建议及时报告、就医，并准备相关证据申请工伤认定。如有需要，可寻求专业律师的法律帮助。