结论前置：机关单位职工在两个单位同时领取福利是否违规，需结合具体情形判断，主要涉及是否违反《公务员法》《事业单位人事管理条例》及单位内部规定。以下是具体分析：

1. 若两个单位存在隶属或关联关系（如上下级、同一系统内）

根据《公务员法》第五十九条及《事业单位工作人员处分暂行规定》第十六条，公务员或事业单位人员不得“违反规定从事或者参与营利性活动，或者在企业或者其他营利性组织中兼任职务”，且“不得违反有关规定从事有偿中介活动”。

• 违规情形：若职工在两个关联单位同时领取福利（如津贴、补贴、实物等），可能被认定为“重复享受待遇”，违反财政纪律或单位内部福利分配规则。
  
• 后果：轻则责令退还违规所得，重则给予警告、记过甚至开除处分。

2. 若两个单位无隶属关系，且职工通过合法兼职领取福利

根据《公务员法》第四十四条，公务员因工作需要在机关外兼职的，应当经有关机关批准，并不得领取兼职报酬。事业单位人员兼职规定类似（如《事业单位人事管理条例》第二十八条）。

• 合规情形：若职工经批准在非关联单位兼职（如学术研究、社会公益），且兼职单位发放的福利属于合法劳动报酬（如课时费、咨询费），通常不违规。
  
• 违规情形：若未经批准兼职，或兼职单位发放的福利超出合理范围（如额外补贴、礼品），可能被认定为“违规兼职取酬”，需承担纪律责任。

3. 若福利属于“重复发放”或“变相加薪”

即使两个单位无直接关联，若职工通过虚假申报、隐瞒信息等方式在两处同时领取福利（如住房补贴、交通补贴），可能涉嫌“骗取财政资金”或“违反廉洁纪律”。

• 法律后果：根据《财政违法行为处罚处分条例》，可能面临行政处罚（如罚款、没收违法所得）；情节严重的，可能构成贪污罪或诈骗罪（需达到刑事立案标准）。

建议

1. 核查单位规定：优先确认两单位是否允许职工同时享受福利，部分单位可能通过内部文件明确禁止。
   
2. 主动报备：若需在两单位兼职或领取福利，应提前向单位人事部门报备，确保程序合法。
   
3. 避免利益冲突：确保兼职或福利领取不影响本职工作，不损害单位利益。
   

温馨提示：若您具体涉及某类福利（如津贴、补贴、实物）或单位类型（如行政机关、事业单位），可进一步说明，我将为您细化分析。