在投诉案件办理过程中，投诉人不配合调查，并不能直接作为终止案件的依据。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

一、法律程序与原则

1. 程序正当性：法律程序强调公正、公平和公开。在投诉案件中，调查是查明事实、分清责任的关键环节。投诉人不配合调查，虽然可能给调查带来困难，但并不能因此剥夺其通过法律程序维护自身权益的权利。

2. 无罪推定与举证责任：在刑事案件中，遵循无罪推定原则，即未经法院依法判决，对任何人都不得确定有罪。同时，举证责任通常由控方承担。在投诉案件中，若涉及类似原则，投诉人不配合调查并不意味着其有罪或应承担不利后果，除非有充分证据证明其违法行为。

二、投诉人不配合调查的影响

1. 调查难度增加：投诉人不配合调查，可能导致调查人员难以获取关键证据，从而增加调查难度和时间成本。但这并不意味着调查无法进行或案件应终止。

2. 证据收集受限：在投诉案件中，证据的收集是关键。投诉人不配合可能导致部分证据无法获取，但调查人员仍可通过其他途径（如询问其他证人、调取相关记录等）收集证据。

三、终止案件的法定条件

1. 法定终止情形：根据相关法律法规，终止案件通常需要满足法定条件，如证据不足、超过追诉时效、犯罪嫌疑人死亡等。投诉人不配合调查并不属于这些法定终止情形之一。

2. 程序合法性：即使投诉人不配合调查，调查机关也应依法进行调查，并确保程序的合法性。若因投诉人不配合而擅自终止案件，可能构成程序违法。

四、应对建议

1. 加强沟通与引导：调查机关可以尝试与投诉人进行沟通，了解其不配合的原因，并引导其配合调查。这有助于查明事实、分清责任。

2. 依法采取强制措施：若投诉人无正当理由拒不配合调查，且其行为可能妨碍调查的进行，调查机关可以依法采取强制措施（如传唤、拘传等），以确保调查的顺利进行。但需注意，强制措施的采取应严格遵循法定程序和条件。

3. 综合运用其他证据：在投诉人不配合调查的情况下，调查机关应综合运用其他证据（如物证、书证、证人证言等）来查明事实。只要证据充分、确凿，仍可以依法对案件进行处理。

综上所述，投诉案件办理过程中投诉人不配合调查，并不能直接作为终止案件的依据。调查机关应依法进行调查，并确保程序的合法性。若遇到投诉人不配合的情况，可以加强沟通与引导、依法采取强制措施或综合运用其他证据来查明事实。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。