公司同事打架产生的医药费公司垫付后，扣被打员工的工资是不合理的，除非符合特定条件且操作合法。以下从不同角度为您详细分析：
一、公司无权随意扣除员工工资
根据《工资支付暂行规定》第十六条：“因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。”
前提条件：公司要扣除员工工资，必须满足“因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失”这一前提。在同事打架的情境中，除非能证明被打员工对打架事件负有直接责任，且该责任导致了公司经济损失（如医药费垫付），否则公司无权扣除其工资。
扣除限额：即使满足前提条件，公司扣除员工工资的数额也受到严格限制。每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
二、公司垫付医药费的处理方式
责任划分：同事之间打架产生的医药费，首先应根据双方的责任进行划分。如果被打员工无过错或过错较小，那么公司垫付的医药费不应由其承担。
追偿途径：如果公司认为需要追偿垫付的医药费，应通过合法途径进行，如与涉事员工协商、通过内部调解机制解决，或者依法向法院提起诉讼，要求责任方承担赔偿责任。而不是直接扣除被打员工的工资。
三、法律建议
与公司沟通：如果您作为被打员工，认为公司扣除工资的行为不合理，可以首先与公司进行沟通，明确表达自己的立场和理由，要求公司停止不当扣除。
寻求法律援助：如果沟通无果，您可以向当地劳动监察部门投诉，或者依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，维护自己的合法权益。
温馨提示：在处理此类纠纷时，请务必保留好相关证据，如工资条、扣款通知、打架事件的证据等，以便在需要时提供证明。如果您有任何法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询，我会为您提供专业的法律建议。