结论：公司因员工在公司打架而扣钱是否合法，取决于多个因素，包括公司是否有合法有效且公示的规章制度、扣钱是否符合规定比例、以及是否给公司造成了实际经济损失等。以下是对此问题的详细分析：
合法情况分析
规章制度的合法性：
- 公司需拥有合法有效的规章制度，该制度需经过民主程序制定，即通过职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定。
- 规章制度需向劳动者公示，如通过入职培训讲解、公司公告栏张贴等方式让员工知晓。若规章制度中明确将打架斗殴行为列为严重违纪情形，并规定了相应的扣工资处罚措施，且员工知晓并实施了打架斗殴行为，公司依据规章制度扣工资，在一定程度上是合法的。
扣工资的限制：
- 根据《工资支付暂行规定》第十六条，每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。
- 扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准，否则按最低工资标准支付。若公司扣工资的数额符合这些限制，则扣工资行为合法。
经济损失的考量：
- 如果打架斗殴事件给公司造成了实际经济损失，且有证据证明损失存在及具体数额，公司要求员工赔偿并从工资中扣除合理赔偿部分，可能具有一定合法性。但需确保扣除的赔偿金额在合理范围内，且不影响员工的基本生活需求。
不合法情况分析
规章制度的缺失或无效：
- 若公司没有相关合法有效的规章制度，或规章制度未明确打架斗殴行为的扣工资规定，扣工资行为不合法。
扣工资超出限制：
- 若扣工资的数额超过了员工当月工资的20%，或扣除后的剩余工资低于当地月最低工资标准，扣工资行为不合法。
无经济损失或损失不明确：
- 若公司仅因打架斗殴行为本身，而未考虑是否造成经济损失就扣除工资，或无法证明经济损失的存在及具体数额，扣工资行为不合法。
法律建议
- 对于公司：应建立合法、合理的规章制度，明确打架斗殴等违纪行为的处罚措施，并通过民主程序制定和公示。在扣工资前，应确保有充分的证据证明员工的行为给公司造成了经济损失，并确保扣除的金额在合理范围内。
- 对于员工：若认为公司的扣工资行为不合法，可首先与公司进行协商，要求公司说明扣工资的原因和依据。协商不成时，可向劳动监察大队投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
法律依据
- 《工资支付暂行规定》第十六条：因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
- 《中华人民共和国劳动法》第五十条：工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
在处理此类问题时，公司应确保规章制度的合法性、内容的合理性以及执行程序的合规性；而员工则应了解自己的权益并依法维护。若您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。