针对您提出的问题，即第一次土地转让合同没有办理行政登记手续，第二次有转让，第二次转让是否有限制，以下是我的详细解答：
土地转让合同登记的重要性：
- 土地转让合同的行政登记手续是土地流转过程中的重要环节，它有助于确认土地流转的合法性和有效性，保护当事人的合法权益。未办理行政登记手续的土地转让合同，在法律上可能存在一定的瑕疵，但这并不直接导致合同无效，而是可能影响其对抗第三人的效力。
第二次转让的限制分析：
- 若第一次转让未登记但合同有效：
- 根据《农村土地承包法》及相关规定，土地经营权流转需签订书面流转合同，并经发包方同意（对于转让而言）。若第一次转让虽未登记，但合同内容合法、双方意思表示真实，且已履行主要义务（如土地实际交付），则该合同可能被视为有效。在此情况下，第二次转让若得到原承包方（即第一次转让的受让方）的书面同意，并向本集体经济组织备案，则第二次转让在法律上通常是允许的。
- 若第一次转让因未登记而存在效力瑕疵：
- 如果第一次转让因未办理行政登记手续而被认为存在效力瑕疵（如无法对抗善意第三人），则这可能影响第二次转让的合法性。具体来说，如果第一次转让的受让方在未取得合法土地经营权的情况下进行第二次转让，那么第二次转让可能因缺乏合法基础而面临被宣告无效的风险。
- 特殊限制情形：
- 还需注意，如果第一次流转合同中明确限制了再次转包，那么第二次转让将受到该限制的约束，无法进行。
法律建议：
- 完善登记手续：对于未办理行政登记手续的土地转让合同，建议尽快补办相关手续，以完善合同的法律效力。
- 审查合同条款：在进行第二次转让前，应仔细审查第一次转让合同的条款，特别是关于再次转包的限制性规定。
- 遵循法定程序：进行土地转让时，应严格遵循《农村土地承包法》及相关规定，签订书面流转合同，并经发包方同意（对于转让而言），同时向本集体经济组织备案。
总结来说，第二次土地转让是否有限制，取决于第一次转让合同的效力、是否得到原承包方的书面同意及备案情况，以及第一次流转合同中是否存在限制再次转包的条款。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。