土地使用权转让合同无效时，土地使用权登记是否有效需分情况讨论：

1. 合同无效但登记行为本身不违法：

   • 如果土地使用权转让合同因违反法律、行政法规的强制性规定而无效，但土地使用权登记行为本身并未违反相关法律法规，且登记机构在办理登记时已尽到合理审查义务，那么土地使用权登记在形式上可能仍然有效。然而，这种有效性仅限于登记行为的表面效力，并不意味着土地使用权的实际归属或转让得到了法律的认可。
   • 例如，若转让方未经有批准权的人民政府批准，擅自与受让方签订土地使用权转让合同，并办理了土地使用权变更登记手续，此时合同因违反强制性规定而无效，但登记行为本身可能因程序合规而暂时保持有效。不过，受让方并不能因此取得合法的土地使用权，因为物权变动的基础（即有效的转让合同）已不存在。

2. 合同无效导致登记行为被撤销或认定无效：

   • 在某些情况下，如果土地使用权转让合同的无效性直接影响到土地使用权登记的合法性，或者登记机构在办理登记时存在过错（如未尽到合理审查义务），那么土地使用权登记可能被撤销或认定无效。
   • 例如，若转让方在签订合同时未取得土地使用权证书，且在起诉前或申请仲裁前也未能取得，此时合同因违反法律规定而无效。若受让方据此办理了土地使用权变更登记手续，登记机构在发现合同无效后，可能依法撤销该登记行为，使土地使用权登记恢复至无效前的状态。

3. 登记行为的独立性与合同效力的关联性：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，不动产物权合同自成立时生效，未办理物权登记的不影响合同效力。然而，这并不意味着登记行为与合同效力完全无关。在土地使用权转让中，登记行为是物权变动的重要公示手段，也是受让方取得合法土地使用权的关键步骤。
   • 因此，在判断土地使用权转让合同无效时土地使用权登记是否有效时，需要综合考虑合同效力、登记行为的合法性以及登记机构在办理登记时的审查义务等因素。

法律建议：

• 对于涉及土地使用权转让的合同，当事人应严格遵守相关法律法规的规定，确保合同的合法性和有效性。
• 在签订土地使用权转让合同前，当事人应充分了解土地使用权的权属状况、登记情况以及是否存在限制转让的情形等信息，以避免因合同无效而导致的法律风险。
• 若土地使用权转让合同被认定无效，当事人应及时采取措施保护自己的合法权益，如请求撤销登记行为、返还已支付的价款等。同时，也可以向我咨询具体的法律处理方案。