当企业职工因患病或非因工负伤需要停止工作进行医疗，并收到停工通知书时，处理方式主要涉及医疗期的安排和工资发放两个方面，以下为您详细阐述：
一、医疗期的安排
医疗期时长：
- 根据职工的实际工作年限和在本单位的工作年限，医疗期时长会有所不同。具体来说，实际工作年限十年以下的，在本单位工作年限五年以下的为三个月；五年以上的为六个月。实际工作年限十年以上的，医疗期则根据在本单位的工作年限进一步细分为六个月至二十四个月不等。
医疗期计算：
- 医疗期从病休第一天开始累计计算。例如，应享受三个月医疗期的职工，如果从某年3月5日起第一次病休，那么其医疗期应在3月5日至9月5日之间确定，在此期间累计病休三个月即视为医疗期满。
- 医疗期内如遇法定休假日、休息日，这些天数也包含在医疗期内。
医疗期内的病休安排：
- 职工在医疗期内应按照医生的建议进行病休，并保留好相关的医疗证明和病假条，以便后续与用人单位进行沟通和确认。
二、医疗期间的工资发放
工资发放原则：
- 根据相关法律法规，劳动者因病或非因工负伤停止工作进行治疗，在国家规定的医疗期内，用人单位应当依照劳动合同、集体合同的约定或者国家有关规定支付病伤假期工资。
工资发放标准：
- 用人单位支付的病伤假期工资不得低于当地最低工资标准的百分之八十。这一标准确保了职工在医疗期间的基本生活需求。
三、处理建议
与用人单位沟通：
- 职工在收到停工通知书后，应及时与用人单位的人力资源部门或相关负责人进行沟通，了解医疗期的具体安排和工资发放情况。
保留相关证据：
- 职工应保留好医疗证明、病假条等相关证据，以便在需要时提供给用人单位或相关部门进行核实。
关注医疗期满后的安排：
- 职工在医疗期满后，应关注用人单位对其工作安排的安排，如是否能够返回原岗位工作或需要进行岗位调整等。
综上所述，当企业职工因患病或非因工负伤收到停工通知书时，应了解医疗期的安排和工资发放情况，并与用人单位进行积极沟通，以确保自己的合法权益得到保障。