调休假过期作废是否合法，需视具体情况而定，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
合法情形
规章制度明确且合法：
- 如果用人单位在劳动合同或依法制定并公示的规章制度中明确规定了调休假过期作废，且该规定不违反法律法规的强制性规定，同时劳动者在知晓该规定的情况下，未在调休期限内及时使用调休假，那么用人单位依据此规定让调休假过期作废，具有一定合理性。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。规章制度确定后，应当公示或者告知劳动者。
劳动者同意：
- 如果劳动者在知晓调休假过期作废的规定后，明确表示同意或未提出异议，并在实际工作中接受了这一安排，那么可以视为劳动者对调休假过期作废的认可。
非法情形
规章制度未公示或告知：
- 如果用人单位未将调休假过期作废的规定明确告知劳动者，或者该规定未经民主程序制定且未公示，那么劳动者可能并不知晓这一规定。在这种情况下，用人单位依据未公示或告知的规定让调休假过期作废，可能侵犯劳动者的合法权益。
- 法律后果：根据《中华人民共和国劳动合同法》第八十条，用人单位直接涉及劳动者切身利益的规章制度违反法律、法规规定的，由劳动行政部门责令改正，给予警告；给劳动者造成损害的，应当承担赔偿责任。
明显不合理限制劳动者权益：
- 如果调休假过期作废的规定明显不合理地限制了劳动者的权益，例如在劳动者因不可抗力等合理原因未能及时使用调休假的情况下，用人单位仍坚持调休假过期作废，就可能侵犯劳动者的合法权益。
- 法律原则：根据《中华人民共和国劳动法》第三条，劳动者享有平等就业和选择职业的权利、取得劳动报酬的权利、休息休假的权利等。用人单位应当保障劳动者的这些基本权利。
违反地区特别规定：
- 部分地区可能存在相关劳动法规或政策，对调休假的使用和有效期有特别规定。如果用人单位的规定违反了这些特别规定，那么该规定可能无效。
- 建议：用人单位应密切关注当地劳动法规和政策的变化，确保调休假制度合法合规。
法律建议
对于用人单位：
- 在制定调休假制度时，应确保制度内容合法合规，并经过民主程序制定和公示。
- 在与劳动者签订劳动合同时，应明确调休假的使用规则和有效期等条款。
- 在实际执行过程中，应尊重劳动者的合法权益，避免不合理地限制劳动者的调休权益。
对于劳动者：
- 在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于调休假的使用规则和有效期等条款。
- 在实际工作中，应合理安排调休时间，避免调休假过期作废。
- 如果发现用人单位的规定违反法律法规或侵犯自己的合法权益，应及时向劳动行政部门投诉或寻求法律援助。
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