结论：小区改造中只拆违规花园而不拆违建房是否合法，需根据具体情况判断，包括违建房的性质、是否取得合法手续、是否符合规划要求以及改造项目的具体目标等。

一、违建房的性质与合法性

1. 未经批准建设的房屋：如果违建房是未经相关部门批准，擅自建设的房屋，那么这类房屋本身就是违法的。在小区改造中，如果仅拆除违规花园而保留此类违建房，显然是不合法的，因为这违反了城市规划和建设管理的相关规定。

2. 已取得合法手续的房屋：如果违建房在建设过程中已经取得了相关的合法手续，如规划许可证、施工许可证等，并且符合城市规划和建设管理的要求，那么这类房屋在法律上是被认可的。在小区改造中，如果仅因为花园违规就拆除花园，而保留此类合法房屋，则是合法的。但这种情况较为少见，因为通常违建房指的是未经批准或违反规划建设的房屋。

二、改造项目的具体目标与规划要求

1. 改造目标：小区改造的目标可能包括提升居住环境、改善基础设施、增加公共空间等。如果改造目标主要是针对花园等公共区域进行提升，而违建房并未对改造目标造成实质性影响，那么在改造中可能仅拆除违规花园。但这并不意味着保留违建房就是合法的，而是需要综合考虑多种因素。

2. 规划要求：城市规划对小区内的建筑布局、绿化面积等都有明确要求。如果违建房违反了这些规划要求，那么在小区改造中应当被拆除。如果仅拆除违规花园而保留违建房，可能无法满足规划要求，从而构成违法。

三、法律程序与公众参与

1. 法律程序：在小区改造中，拆除任何建筑或设施都需要遵循相应的法律程序。这包括发布公告、听取意见、进行评估等。如果仅拆除违规花园而未对违建房进行合法程序的处理，可能构成程序违法。

2. 公众参与：小区改造涉及居民的切身利益，应当充分听取居民的意见和建议。如果居民对保留违建房有异议，并且这种异议符合法律法规和规划要求，那么在改造中应当考虑居民的意见，对违建房进行相应处理。

四、建议与措施

1. 核查违建房性质：在小区改造前，应当对违建房的性质进行核查，确定其是否合法。对于不合法的违建房，应当依法进行拆除。

2. 遵循规划要求：小区改造应当遵循城市规划和建设管理的相关要求，确保改造后的环境符合规划标准。

3. 充分听取意见：在改造过程中，应当充分听取居民的意见和建议，确保改造方案符合居民的期望和需求。

4. 依法进行改造：小区改造应当遵循相应的法律程序，确保改造过程的合法性和合规性。

总结：小区改造中只拆违规花园而不拆违建房是否合法，需根据违建房的性质、是否取得合法手续、是否符合规划要求以及改造项目的具体目标等多种因素进行综合判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。