结论：船员在禁渔期捕捞受伤，保险公司是否赔偿需视具体情况而定，主要取决于保险合同条款、事故性质及法律责任划分。以下分情况说明：

1. 保险合同条款的覆盖范围

• 若保险合同明确承保“非法作业”导致的伤害：
  部分商业保险或雇主责任险可能通过特别条款扩展承保范围，但此类条款极为罕见。需核查保单是否明确排除“违反法律法规行为”的免责条款。若未排除，保险公司可能需赔偿。
• 若保险合同明确免责“非法作业”：
  主流保险产品（如船员意外险、雇主责任险）通常将“违反渔业管理法规（如禁渔期捕捞）”列为免责事由。此时，保险公司有权拒赔。

2. 事故性质与法律责任

• 船员无过错（如设备故障导致受伤）：
  即使作业非法，船员作为劳动者可能仍享有工伤赔偿权利。根据《工伤保险条例》，劳动者因工作原因受伤，原则上应认定为工伤，但需注意：
  
  • 禁渔期捕捞可能被认定为“非法用工”，此时赔偿标准可能低于正规工伤；
    
  • 若雇主未缴纳工伤保险，需由雇主自行承担赔偿责任。
• 船员存在故意或重大过失：
  若船员主动参与非法捕捞且存在操作违规（如未穿戴安全设备），保险公司可能以“故意违法行为”为由拒赔，同时雇主可能减轻赔偿责任。

3. 雇主责任与保险的衔接

• 雇主未尽安全保障义务：
  即使作业非法，雇主仍需对船员提供基本安全保障（如安全设备、培训）。若雇主未履行义务导致受伤，可能需承担部分赔偿责任，但保险公司仍可能以“非法作业”为由拒赔。
• 雇主责任险的覆盖：
  若雇主投保了雇主责任险，需核查保单是否将“非法作业”列为免责。若未免责，保险公司可能需赔偿；若免责，雇主需自行承担。

4. 行政处罚与民事赔偿的区分

• 禁渔期捕捞的行政责任：
  船员和雇主可能面临渔业主管部门的罚款、没收渔具等处罚，但这与民事赔偿无关。行政处罚不直接影响保险公司是否赔偿，但可能作为“非法作业”的证据。

建议行动

1. 核查保险合同：重点查看“责任免除”条款，确认是否排除“非法作业”；
   
2. 固定证据：收集事故现场照片、医疗记录、证人证言等，证明受伤与作业的因果关系；
   
3. 区分法律关系：
   
   • 若主张工伤，需向劳动部门申请工伤认定；
     
   • 若主张保险赔偿，需向保险公司提交理赔申请并附完整证据；
     
4. 协商或诉讼：若保险公司拒赔，可尝试协商或通过法律途径解决。

提示：禁渔期捕捞不仅涉及民事赔偿，还可能承担行政或刑事责任。建议优先通过合法途径作业，避免法律风险。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体案件细节。