核心前提：新合同尚未签订，但相关款项已产生，需要补付费用。

结论与建议：

1. 确认费用性质与依据：

   • 首先，需要明确已产生的款项是基于何种法律关系或事实依据，例如是预付款、定金、服务费还是其他类型的费用。
   • 核查是否有之前的口头协议、邮件往来、订单确认等可以证明双方对费用有初步共识的证据。这些证据将作为补付费用的重要依据。

2. 协商签订补充协议：

   • 鉴于新合同尚未签订，建议双方尽快就已产生的费用及后续合作事宜进行协商，并签订补充协议或新合同。
   • 补充协议中应明确已产生费用的金额、支付方式、支付时间以及后续合作的具体条款，以避免未来产生纠纷。

3. 补付费用流程：

   • 根据协商结果，支付方应按照补充协议或双方认可的方式补付费用。
   • 接收方在收到款项后，应出具相应的收据或发票，以证明款项已收讫。

4. 法律风险防范：

   • 在补付费用的过程中，双方应注意保留相关证据，如转账记录、收据、补充协议等，以备不时之需。
   • 若双方无法就补付费用达成一致，或后续合作出现纠纷，建议及时寻求法律途径解决，如通过调解、仲裁或诉讼等方式维护自身权益。

5. 特殊情况处理：

   • 如果已产生的费用存在争议，如费用金额、支付条件等，双方应首先通过友好协商解决。
   • 若协商无果，可以考虑邀请第三方机构进行调解或评估，以确定合理的费用金额和支付方式。

总结：在新合同未签订但款项已产生的情况下，补付费用的关键在于明确费用性质与依据、协商签订补充协议、按照协议补付费用，并注意法律风险防范。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。