针对您提出的“莫单位员工长期离开单位驻村工作队，过了两年申请回单位遇到麻烦”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，员工长期驻村工作后申请回单位，这一过程中可能会遇到多种情况，包括但不限于单位人员变动、岗位调整、政策变化等。因此，解决这一问题的关键在于与单位进行充分沟通，并了解相关政策。
一、了解政策与规定
查阅单位政策：首先，您应该查阅单位关于驻村工作队员工回单位的相关政策或规定。这些政策可能包括回单位的条件、程序、时间限制等。如果单位有明确的政策文件，那么按照政策执行即可。
咨询相关部门：如果单位政策不明确或您对政策有疑问，可以咨询单位的人力资源部门或相关负责部门。他们可以提供更具体的指导和解释。
二、与单位进行沟通
表达回单位意愿：您应该主动向单位表达您希望回单位的意愿，并说明您驻村工作的情况和成果。这有助于单位了解您的需求和背景。
了解单位情况：在沟通时，您可以询问单位目前的人员情况、岗位需求等，以便更好地了解回单位的可能性和岗位安排。
协商解决方案：如果单位在人员或岗位方面存在困难，您可以与单位协商解决方案，如暂时调整岗位、参与单位的其他项目等。
三、准备相关材料
驻村工作总结：您可以准备一份驻村工作的总结，包括您的工作内容、成果、经验等。这有助于单位了解您在驻村期间的表现和能力。
个人申请：撰写一份个人申请，说明您希望回单位的原因、意愿和计划。申请应该诚恳、具体，并表达您对单位的忠诚和贡献意愿。
四、应对可能遇到的麻烦
人员变动：如果单位在您驻村期间发生了人员变动，导致您的原岗位已被其他人占据，您可以与单位协商调整岗位或参与其他项目。
岗位调整：如果单位对岗位进行了调整，您可以根据自己的专业特长和职业规划，向单位提出适合的岗位建议。
政策变化：如果相关政策发生了变化，导致您回单位的条件或程序发生了变化，您应该及时了解新政策，并按照新政策执行。
五、保持积极态度
在申请回单位的过程中，您可能会遇到一些困难和挑战。但是，保持积极的态度和耐心是非常重要的。与单位进行充分沟通，理解单位的难处和需求，同时表达自己的意愿和计划，有助于找到更好的解决方案。
最后，我希望您能够顺利回到单位，并继续为单位的发展做出贡献。如果您在申请过程中遇到任何问题或需要进一步的帮助，请随时与我联系。