结论前置：公司若以员工擅自离岗为由进行处理，需要收集一系列证据来证明员工确实存在擅自离岗的行为。这些证据主要包括证明劳动关系的证据、证明员工擅自离岗事实的证据以及其他辅助证据。

一、证明劳动关系的证据

1. 劳动合同：这是最直接的文件，能够明确双方的权利义务、工作岗位以及薪资待遇，是证明劳动关系存在的基础。
2. 工作证、工牌、工作制服：这些印有公司标志和个人信息的物品，可以作为辅助证明员工与公司之间存在劳动关系的证据。
3. 考勤记录：包括打卡记录、考勤表等，能够反映员工的工作时间和出勤情况，间接证明劳动关系的存续。
4. 工资支付记录：如工资条、银行流水明细、电子支付记录等，能够体现员工的劳动报酬情况，进一步证实劳动关系的存在。

二、证明员工擅自离岗事实的证据

1. 监控录像或照片：如果公司安装了监控设备，可以调取员工擅自离岗时的监控录像或照片作为证据。
2. 同事证言：了解情况的同事可以出具书面证言或出庭作证，证明员工确实存在擅自离岗的行为。但需要注意的是，同事证言需要与其他证据相互印证，以增强其证明力。
3. 工作交接记录：如果员工在擅自离岗前未进行工作交接，或者交接记录显示其未完成应尽的工作职责，这也可以作为证明其擅自离岗的证据之一。不过，这种情况更多是作为辅助证据，需要结合其他证据来综合判断。
4. 通讯记录：如员工在擅自离岗期间未回复公司的工作邮件、短信或电话等，这些通讯记录也可以作为辅助证据，证明员工未履行工作职责。

三、其他辅助证据

1. 公司规章制度：如果公司规章制度中明确规定了员工离岗的审批流程和要求，而员工未遵守这些规定擅自离岗，那么公司规章制度也可以作为证明员工违规的证据。
2. 员工手册或培训记录：如果公司向员工发放了员工手册或进行了相关培训，其中包含了关于离岗的规定和要求，而员工未遵守这些规定，那么这些手册或培训记录也可以作为辅助证据。

法律建议与后果

• 法律建议：公司在收集证据时，应确保证据的真实性、合法性和关联性。同时，建议公司在处理员工擅自离岗问题时，遵循公平、公正、合理的原则，避免因处理不当而引发劳动争议。
• 可能法律后果：如果公司无法提供充分的证据证明员工擅自离岗，而员工又否认这一行为，那么公司可能会面临败诉的风险，需要承担相应的法律责任，如支付违法解除劳动合同的赔偿金等。

总结：公司若以员工擅自离岗为由进行处理，需要全面且细致地收集各类证据。在收集证据的过程中，公司应确保证据的真实性、合法性和关联性，并在必要时寻求专业法律意见。如果您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。