当借条上既有公司公章又有法定代表人签字时，一般应起诉公司作为被告。以下是对此结论的详细分析：
一. 法律依据与行为性质
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，法定代表人因执行职务造成的损害由法人承担民事责任。在借条上，法定代表人的签字代表其以公司的名义进行借款行为，因此产生的法律效果归属于公司。
- 《中华人民共和国公司法》第三条规定：“公司是企业法人，有独立的法人财产，享有法人财产权，并以其全部财产对公司的债务承担责任。”这进一步明确了公司作为独立法人，应对其债务承担责任。
行为性质：
- 借条上同时出现公司盖章和法定代表人签字，这通常被视为公司的单位行为。法定代表人在此情境下的签字是履行职务行为，代表的是公司而非个人。
- 公司公章作为公司身份和权力的象征，其出现在借条上即表示公司对该笔债务的认可和承担。
二. 起诉策略
在大多数情况下，当借条上既有公司公章又有法定代表人签字时，应直接起诉公司作为被告。因为此时借款行为被视为公司的行为，而非法定代表人个人的行为。
- 证据准备：在起诉时，应提供借条、公司财务账目记录、借款资金流向公司账户的凭证等证据，以证明借款是公司行为，并用于公司的经营活动。
三. 特殊情况处理
虽然大多数情况下应起诉公司，但在某些特殊情况下，可能需要将法定代表人与公司列为共同被告。例如：
- 如果有充分证据证明借款同时涉及法定代表人个人利益，或者借款实际用于法定代表人个人消费等，那么法定代表人也可能需要承担还款责任。
- 如果借条上同时有借款个人的签名和公司公章，且借款打入法人个人账户，这可能构成表见代理或共同借款行为。在这种情况下，借款人个人和公司可能需要对债务承担连带责任。
然而，这些特殊情况的处理需要依据具体案件的事实和证据来判断。
综上所述，当借条上既有公司公章又有法定代表人签字时，一般应起诉公司作为被告。但在特定情况下，如借款涉及法定代表人个人利益或实际用于个人消费等，可能需要将法定代表人与公司列为共同被告。在实际操作中，建议根据具体案件的事实和证据来做出判断，并确保提供的证据充分、有效，以支持诉讼主张。如有进一步需要，您可以继续咨询我。