公司部门与员工签订的职业危害告知书，在符合法定条件的情况下，是具有法律效力的。以下从不同角度为您详细分析：

一、法律效力的一般条件

1. 双方真实意思表示：告知书必须是双方真实意愿的体现，即员工在充分理解告知书内容的基础上自愿签署，不存在欺诈、胁迫等情形。
2. 内容合法合规：告知书的内容必须符合法律法规的规定，不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得损害社会公共利益和他人合法权益。具体来说，应如实告知劳动者职业危害、安全生产状况等关键信息。
3. 形式要件完备：虽然法律并未明确规定职业危害告知书必须采用特定形式，但通常建议采用书面形式，并由双方签字或盖章确认，以增强其证明力。

二、职业危害告知书的特定要求

根据《劳动合同法》第八条的规定，用人单位招用劳动者时，应当如实告知劳动者工作内容、工作条件、工作地点、职业危害、安全生产状况、劳动报酬，以及劳动者要求了解的其他情况。因此，职业危害告知书作为用人单位履行告知义务的一种方式，其内容必须全面、准确，不得隐瞒或歪曲事实。

三、法律后果与免责情形

1. 有效告知的法律后果：如果职业危害告知书符合上述条件，且员工已经签字确认，那么在将来发生争议时，用人单位可以以此作为证据，说明员工已经知晓公司相关制度和内容，从而在一定程度上免除或减轻其责任。
2. 无效告知的法律后果：相反，如果告知书存在内容不实、形式要件不完备等问题，或者用人单位未履行告知义务，那么在发生职业危害事故时，用人单位可能需要承担相应的法律责任。

四、实务建议

1. 完善告知书内容：用人单位在制定职业危害告知书时，应确保内容全面、准确，涵盖所有可能存在的职业危害因素及其防范措施。
2. 加强员工培训：除了签订告知书外，用人单位还应组织员工进行职业健康培训，提高员工对职业危害的认识和防范能力。
3. 定期更新告知书：随着工作环境和工艺流程的变化，职业危害因素也可能发生变化。因此，用人单位应定期更新告知书内容，确保其时效性和准确性。

总结来看，公司部门与员工签订的职业危害告知书在符合法定条件的情况下是具有法律效力的。但为了确保其有效性并降低法律风险，用人单位应严格遵守相关法律法规的规定，完善告知书内容并加强员工培训。如果您在职业危害告知书方面还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。