将工资拆开由两个公司发放，是否合法需分情况讨论：
若拆分出于合理业务安排，通常不违法：
- 例如，员工同时为两家关联公司提供劳务，且两家公司分别依据员工实际工作内容与工作量依法支付工资。这种情况下，工资拆分是合理的业务安排，不违反劳动法律法规。
若拆分目的在于规避法定义务，则可能违法：
- 如果拆分工资的目的是为了规避相关法定义务，如社保费用不足、未支付足额加班工资、降低离职补偿标准等，那么这种行为可能构成违法。根据法律规定，用人单位应按劳动合同及国家规定，按时足额支付员工薪酬。擅自改变工资发放主体，且无正当理由，可能会被视为违反劳动法律法规。
针对您提到的“仲裁费”问题，需明确以下几点：
- 仲裁费通常指的是劳动争议仲裁过程中产生的费用，这与工资拆分是否合法无直接关联。但如果您是在询问因工资拆分问题而申请劳动仲裁时是否需要支付费用，那么根据相关规定，劳动争议仲裁是不收费的。不过，如果仲裁后您对结果不满并提起诉讼，则可能需要承担一定的诉讼费用。
若您遇到工资拆分问题并考虑维权，建议采取以下步骤：
- 收集证据：首先，收集与工资拆分相关的所有证据，包括劳动合同、工资条、银行转账记录等。
- 与用人单位协商：尝试与用人单位进行沟通协商，明确表达您的诉求，要求其纠正不当的工资拆分行为。
- 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，您可以向当地劳动监察部门投诉，请求其介入调查并处理。
- 申请劳动仲裁：在投诉无果的情况下，您可以向当地劳动争议仲裁委员会提起仲裁申请，要求用人单位支付应得的工资及可能的赔偿。
- 提起诉讼：如果对仲裁裁决结果不满，您还可以在收到仲裁裁决书之日起十五日内向有管辖权的人民法院提起诉讼。
最后，需要强调的是：
- 工资拆分是否合法，关键在于其目的和实施方式。如果拆分是出于合理业务安排且符合法律法规，那么通常是合法的；但如果拆分是为了规避法定义务或损害员工权益，那么就可能构成违法。
- 在处理此类问题时，建议您保持冷静和理性，通过合法途径维护自己的权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。