和解协议履行完毕后，执行程序通常应当终结，但需满足特定条件且遵循相应程序。以下是对此问题的详细分析：
一、和解协议履行完毕的法律效果
执行终结的法律依据：
- 根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第四百六十七条，以及《最高人民法院关于执行和解若干问题的规定》的相关条款，和解协议已经履行完毕的，人民法院不予恢复执行，即执行程序应当终结。
执行终结的常见情形：
- 债务履行完毕：在借款合同纠纷等案件中，被执行人按和解协议支付全部款项，申请执行人确认收到且无异议，法院可终结执行。
- 其他义务履行完成：如房屋租赁合同纠纷中，被执行人完成修复、打扫等约定行为，经申请执行人验收合格后，法院亦可终结执行。
二、和解协议履行完毕后的处理
法院的结案处理：
- 当和解协议履行完毕后，执行法院会作出执行结案处理，即终结执行程序。这是对和解协议履行完毕的正式确认，也是执行程序终结的法律依据。
申请执行人的权利保障：
- 如果申请执行人因被执行人迟延履行、瑕疵履行遭受损害的，可以根据《最高人民法院关于执行和解若干问题的规定》第十五条，向执行法院另行提起诉讼，以此保障自身权益。
三、特殊情况下的处理
和解协议存在瑕疵：
- 如果和解协议在履行过程中存在欺诈、胁迫等法定可撤销情形，一方当事人可申请撤销和解协议。一旦撤销，法院将恢复对原生效法律文书的执行。
申请执行人反悔：
- 理论上，如果申请执行人在和解协议履行完毕后反悔，并试图恢复执行原生效法律文书，这通常是不被允许的。因为和解协议的履行完毕已经构成了对原执行程序的终结。然而，如果申请执行人能证明和解协议存在重大误解或显失公平等情形，并依法提起诉讼或申请撤销和解协议，那么在特定情况下，法院可能会考虑恢复执行。但这种情况非常罕见，且需要严格的法律程序和证据支持。
四、实际案例中的处理
- 以吴某与张某民间借贷纠纷一案为例，张某虽迟延履行执行和解协议，但在吴某申请恢复执行当日已经履行完毕。法院认为，张某虽有迟延履行行为，但并未导致执行和解协议目的不能实现，且张某陆续有还款行为，代表其在积极履行执行和解协议。因此，法院裁定不予恢复执行，即执行程序终结。
五、建议与注意事项
- 严格遵守和解协议：双方当事人在达成和解协议后，应严格遵守协议内容，确保按时、按质、按量履行义务。这是避免执行程序恢复和保障自身权益的关键。
- 及时沟通与协商：在履行过程中，如果遇到任何问题或困难，双方应及时沟通与协商，寻求解决方案。避免因沟通不畅或协商无果而导致执行程序恢复或产生其他法律纠纷。
- 保留相关证据：双方当事人在履行和解协议过程中，应保留好相关证据，如还款凭证、验收报告等。这些证据在后续可能出现的法律纠纷中具有重要的证明作用。
总结来看，和解协议履行完毕后，执行程序通常应当终结。但双方仍需注意特殊情况下的处理，并严格遵守和解协议以确保自身权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。