事业单位病假期间，基础性绩效工资可以被扣，但具体扣除比例和条件需依据地方规定及单位政策，且扣除后的工资不得低于当地最低工资标准的80%。以下从不同角度进行详细分析：
一、法律框架与原则
病假工资的法定标准：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》及相关地方性法规，员工在病假期间，用人单位应支付病假工资或疾病救济费，该费用可以低于当地最低工资标准，但不得低于最低工资标准的80%。
绩效工资的性质：
- 绩效工资通常是根据员工的工作表现、工作成果或单位效益等因素确定的奖励性待遇。在员工病假期间，由于未实际参与工作，因此单位可能停发或部分停发绩效工资。
二、地方规定与单位政策
地方性规定：
- 不同地区可能根据实际情况制定了具体的事业单位病假工资和绩效工资政策。例如，某些地区可能规定病假超过一定期限后，基础性绩效工资按一定比例计发。以长武县为例，病假超过6个月的，从第七个月起，基础性绩效工资按70%计发。
单位内部政策：
- 事业单位可能根据自身情况制定了更为详细的病假工资和绩效工资政策。这些政策通常会在单位内部进行公示，并作为处理病假工资问题的依据。
三、具体扣除情况与建议
病假期限与绩效工资扣除：
- 病假在2个月以内的，绩效工资（包括基础性绩效工资和奖励性绩效工资）通常照发。
- 病假超过2个月不满6个月的，从第3个月起，可能停发奖励性绩效工资，但基础性绩效工资可能仍全额发放或按一定比例发放。
- 病假超过6个月的，从第7个月起，可能停发奖励性绩效工资，基础性绩效工资则可能按较低比例（如70%）计发。
建议与注意事项：
- 查阅地方规定：员工应首先查阅所在地区关于事业单位病假工资和绩效工资的具体规定，以了解自身权益。
- 咨询单位人事部门：员工可向单位人事部门咨询病假工资和绩效工资的具体政策，确保自身权益不受侵害。
- 保留证据：在病假期间，员工应保留好相关医疗证明和病假申请等证据，以备不时之需。
- 法律途径：如认为单位扣除绩效工资的行为违法或不合理，员工可通过法律途径维护自身权益。
四、法律后果与风险提示
违法扣除的法律后果：
- 如果单位违反规定扣除员工病假期间的基础性绩效工资，且扣除后的工资低于当地最低工资标准的80%，则可能面临劳动监察部门的处罚，并需补发员工工资及可能的经济补偿。
风险提示：
- 员工在病假期间应密切关注自身工资发放情况，如发现单位存在违法扣除行为，应及时向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
总结：事业单位病假期间基础性绩效工资的扣除需依据地方规定和单位政策进行。员工应了解自身权益，并在必要时通过法律途径维护自身利益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。