事业单位病假期间是否扣绩效工资，需根据具体情况判断，主要取决于单位规章制度、病假时长及当地政策规定。以下从不同角度详细分析：

1. 单位规章制度层面
   事业单位的工资构成通常包括基本工资、绩效工资等部分。根据《事业单位人事管理条例》第三十二条，事业单位工作人员工资包括基本工资、绩效工资和津贴补贴，且工资调整需遵循国家规定。但具体到病假期间绩效工资的发放，法律并未明确禁止或允许扣除，而是赋予单位一定自主权。

   • 若单位规章制度明确规定“病假期间绩效工资按比例发放或扣除”，且该制度经民主程序制定（如职工代表大会讨论通过）并公示，则单位可依据制度执行。
     
   • 若制度未明确规定，或规定与法律冲突（如完全扣除绩效工资导致工资低于当地最低标准），则单位行为可能违法。

2. 病假时长与工资发放的关联
   根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》（虽针对企业，但事业单位可参考），医疗期内工资发放需遵循以下原则：

   • 短期病假（如3个月内）：单位通常需支付基本工资，绩效工资可能根据实际出勤或工作成果发放。若员工未提供劳动，单位扣除绩效工资具有合理性。
     
   • 长期病假（超过医疗期）：若员工医疗期满后仍无法返岗，单位可依法解除劳动合同，但医疗期内不得随意扣减工资。部分地区规定，医疗期内工资不得低于当地最低工资的80%，此时绩效工资可能被纳入计算范围。

3. 地方政策差异
   部分地区对事业单位病假工资有具体规定。例如：

   • 北京市：事业单位工作人员病假期间，基本工资全额发放，绩效工资按单位规定执行，但不得低于基本工资的70%。
     
   • 上海市：明确病假工资计算基数包括基本工资和绩效工资，且不得低于当地最低工资标准。
     
   • 其他地区：需查阅当地人社部门发布的文件，部分地区可能允许单位在合理范围内调整绩效工资。

法律建议：

1. 核查单位制度：首先查看单位规章制度或劳动合同中关于病假工资的条款，确认是否明确规定绩效工资的发放方式。
   
2. 咨询当地人社部门：若制度模糊或存在争议，可向当地人力资源和社会保障局咨询，了解地方政策对事业单位病假工资的具体要求。
   
3. 协商或申诉：若单位无故扣减绩效工资，可与单位协商解决；协商不成，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
   

示例：

• 若某事业单位规定“病假1个月内绩效工资全额发放，超过1个月按50%发放”，且该制度合法有效，则员工病假2个月时，第2个月绩效工资可扣除50%。
  
• 若当地政策明确“病假期间工资不得低于最低工资标准”，而单位扣除绩效工资后工资低于该标准，则单位行为违法。
  

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