关于“农村自建房登记在兄弟两人名下，夫妻一方是否可以起诉”的问题，这主要取决于具体的法律关系和诉讼理由。以下是我根据几种可能的情况给出的分析：

1. 若涉及夫妻共同财产分割：

   • 如果该自建房是夫妻双方在婚姻关系存续期间共同出资建造的，即便登记在兄弟两人名下，也可能被视为夫妻共同财产的一部分。在这种情况下，夫妻一方若认为其财产权益受到侵害，可以基于夫妻共同财产分割的诉求向法院提起诉讼，要求确认其对该房产的份额并进行相应分割。

2. 若涉及物权确认纠纷：

   • 如果夫妻一方认为该自建房实际上应归其所有，但由于某种原因被错误地登记在兄弟两人名下，那么可以提起物权确认之诉，请求法院确认该房产的归属，并要求更正登记。

3. 若涉及其他法律纠纷：

   • 除了上述两种情况外，还可能存在其他法律纠纷，如继承权纠纷、赠与合同纠纷等。在这些情况下，夫妻一方是否可以起诉以及具体的诉讼理由和请求，将取决于具体的法律事实和法律规定。

综上所述，夫妻一方是否可以起诉，取决于具体的法律关系和诉讼理由。如果涉及上述任何一种情况或其他法律纠纷，建议夫妻一方咨询专业律师（即我），详细陈述案情，以便获得更具体的法律分析和建议。同时，也需要注意收集相关证据，以支持自己的诉讼主张。