结论前置：在劳动合同中写明的工资是3200元，但实际发放了4000元的情况下，一般应以实际发放的工资4000元为准，但具体还需结合劳动合同的其他条款以及公司的相关规章制度来确定。

分析说明：

1. 合同约定与实际履行的关系：

   • 劳动合同是劳动者与用人单位之间约定权利义务的书面协议，其中明确约定了工资数额。然而，在实际履行过程中，用人单位可能会根据经营情况、员工的工作表现或其他因素调整工资数额。
   • 当实际发放的工资与劳动合同中约定的工资不一致时，一般应优先考虑实际履行的情况，即实际发放的工资数额。

2. 法律对工资的规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》和相关法律法规，用人单位应当按照劳动合同约定的工资数额向劳动者支付工资。
   • 但如果实际发放的工资高于劳动合同中约定的工资，且劳动者对此没有异议，那么可以视为用人单位与劳动者之间对工资数额进行了实际上的变更。

3. 公司规章制度的影响：

   • 有些公司可能有关于工资调整或发放的规章制度，这些规章制度可能对实际发放的工资数额产生影响。
   • 如果公司的规章制度明确规定了工资调整或发放的条件和程序，并且这些规章制度不违反法律法规的强制性规定，那么在实际发放工资时，应当遵循这些规章制度。

4. 建议与注意事项：

   • 对于劳动者来说，如果实际发放的工资高于劳动合同中约定的工资，并且对此没有异议，那么可以继续接受这种工资支付方式。
   • 但如果劳动者对实际发放的工资有异议，或者认为用人单位存在违反劳动合同或法律法规的行为，那么应当及时与用人单位沟通协商，或者向劳动监察部门投诉举报。

综上所述，虽然劳动合同中写明的工资是3200元，但实际发放了4000元，且劳动者对此没有异议的情况下，一般应以实际发放的工资4000元为准。但具体还需结合劳动合同的其他条款以及公司的相关规章制度来确定。如果有任何疑问或纠纷，建议及时与我联系，我将为你提供专业的法律咨询。