结论前置： 公司已发短信要求员工签署劳动合同，员工不配合签署并索要二倍赔偿，法院一般不予支持。

分析说明：

1. 劳动合同的签订与二倍赔偿的适用条件：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应当自用工之日起一个月内与劳动者订立书面劳动合同。若用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。
   • 但在此情况下，公司已主动发短信要求员工签署劳动合同，表明公司有意愿与员工签订书面劳动合同。员工不配合签署，则不符合上述法条中用人单位未与劳动者订立书面劳动合同而应支付二倍工资的情形。

2. 员工不配合签署劳动合同的法律后果：

   • 若员工拒绝签署劳动合同，公司可以视为员工不愿与公司建立劳动关系，并有权根据相关法律法规及公司内部规定，对员工采取相应措施，如终止劳动关系等。
   • 在此过程中，公司应确保自身行为符合法律法规要求，避免侵犯员工合法权益。

3. 建议与提示：

   • 对于公司而言，应完善劳动合同签订流程，确保在员工入职后及时与其签订书面劳动合同，以避免潜在的法律风险。
   • 对于员工而言，应积极配合公司签订劳动合同，以保障自己的合法权益。若对劳动合同内容有异议，可与公司进行协商，或寻求专业法律帮助。

综上所述，公司已发短信要求员工签署劳动合同，员工不配合签署并索要二倍赔偿，法院一般不予支持。建议公司在处理此类情况时，应遵循法律法规要求，确保自身行为合法合规；同时，员工也应积极配合公司签订劳动合同，以维护双方合法权益。