关于您提出的关于离婚诉讼中子女抚养权的问题，核心在于分居期间孩子一直由一方抚养，现在第二次起诉离婚，抚养权会如何判定。以下是我的详细解答：

一、抚养权判定原则

在离婚诉讼中，子女抚养权的判定主要遵循以下原则：

1. 不满两周岁的子女：以由母亲直接抚养为原则。
2. 已满两周岁的子女：由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。这包括考虑父母双方的经济状况、抚养能力、与子女的感情联系、子女的生活环境以及教育需求等因素。
3. 子女已满八周岁的：应当尊重其真实意愿。

二、分居期间抚养情况的影响

分居期间孩子一直由一方抚养这一事实，在离婚诉讼中会被法院作为判定抚养权的一个重要参考因素。但并非决定性因素，法院还会综合考虑其他因素，如上述提到的经济状况、抚养能力等。

三、第二次起诉离婚的影响

第二次起诉离婚本身对抚养权的判定没有直接影响。法院在判定抚养权时，主要关注的是当前及未来的抚养环境是否最有利于子女的成长，而不是诉讼的次数。

四、建议

1. 收集证据：无论您是希望继续抚养子女还是争取抚养权，都应该积极收集有利于自己的证据，如经济状况证明、抚养能力证明、与子女的感情联系证明等。
2. 协商优先：在可能的情况下，双方可以协商解决子女抚养问题，达成一致的抚养协议。这有助于减少诉讼过程中的冲突和不确定性。
3. 寻求专业帮助：如果您在抚养权问题上遇到困难或疑问，可以寻求专业律师的帮助。律师可以为您提供专业的法律建议和指导，帮助您更好地维护自己的权益和子女的利益。

综上所述，分居期间孩子一直由一方抚养这一事实在离婚诉讼中会被法院考虑，但并非决定性因素。法院会综合考虑多种因素来判定抚养权。因此，您应该积极收集证据，争取最有利的抚养环境，并寻求专业帮助以维护自己的权益和子女的利益。