关于建设用地使用权抵押权纠纷的管辖问题，我们可以从以下几个角度进行分析：

1. 一般管辖原则：

   • 根据《民事诉讼法》的相关规定，因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。在建设用地使用权抵押权纠纷中，如果双方有明确的合同约定，且合同中对管辖法院有约定，那么应当按照合同的约定确定管辖法院。
   • 如果没有明确的合同约定或者合同中的管辖约定无效，那么原告可以选择向被告住所地或者合同履行地的人民法院提起诉讼。

2. 专属管辖原则：

   • 根据《民事诉讼法》及最高人民法院的相关司法解释，涉及不动产的纠纷，应当由不动产所在地人民法院专属管辖。建设用地使用权作为不动产权利的一种，其抵押权纠纷也应当适用这一原则。
   • 因此，如果建设用地使用权抵押权纠纷涉及的是不动产的权利确认、分割、相邻关系等引起的物权纠纷，应当由不动产所在地人民法院专属管辖。

3. 特殊情形下的管辖：

   • 在某些特殊情形下，如抵押权人与抵押人之间因抵押权的实现方式、抵押权的效力范围等发生争议，且这些争议不涉及不动产的权利确认、分割等物权纠纷时，可能需要根据合同性质、争议标的等因素来确定管辖法院。
   • 此外，如果抵押权纠纷涉及多个被告，且被告住所地、合同履行地等均不在同一地区时，原告可能需要根据《民事诉讼法》关于共同诉讼、牵连管辖等规定来选择合适的管辖法院。

综上所述，建设用地使用权抵押权纠纷的管辖法院应当根据具体案件情况来确定。在一般情况下，原告可以选择向被告住所地或者合同履行地的人民法院提起诉讼；如果涉及不动产的权利确认、分割等物权纠纷，则应当由不动产所在地人民法院专属管辖。在特殊情形下，还需要根据合同性质、争议标的等因素来综合考虑管辖法院的选择。如果您有具体的案件情况需要咨询，可以直接向我提问，我会为您提供更详细的法律分析和建议。