针对您提出的问题“工资一万多社保基数五千是否合法”，我进行了详细的分析，以下是对您问题的解答：
一、合规性分析
根据相关法律法规，用人单位应当按照职工本人上年度月平均工资总额作为缴费基数来为其缴纳社会保险费。因此，当您的实际工资为一万多元，而社保基数仅为五千元时，这显然是不符合法律规定的。用人单位这种做法不仅侵害了您的合法权益，还可能导致您在未来享受社会保险待遇时遭受损失。
二、对员工的具体影响
养老保险：养老金待遇与缴费基数紧密相关。较低的缴费基数会导致您的个人账户积累减少，从而影响基础养老金的计算，最终可能会降低您退休后领取的养老金金额。
医疗保险：医保个人账户的划入金额通常是依据缴费基数来确定的。较低的基数意味着您的个人账户金额会减少，可用于门诊医疗和购药的资金也会相应减少。此外，在某些地区，住院报销额度也可能与缴费基数挂钩。
其他险种：工伤保险、失业保险和生育保险的待遇同样可能因缴费基数不足而受到影响。例如，失业保险金的领取标准可能会降低，工伤保险的赔付金额也可能减少。
三、员工维权途径
面对这种情况，您可以采取以下措施来维护自己的合法权益：
与单位协商：首先尝试与用人单位进行沟通，明确指出社保缴费基数应按实际工资来确定的法律规定，并要求单位调整缴费基数并补缴差额部分。
向社保经办机构投诉：如果协商无果，您可以向当地社保经办机构进行投诉。社保经办机构有权检查单位的社保缴纳情况，并责令其限期改正及补缴相应费用及滞纳金。
申请劳动仲裁：如果前两步均未能解决问题，您可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求单位按实际工资足额缴纳社保。在仲裁过程中，提供如工资条、银行流水等能证明您工资收入的证据是非常重要的。
四、单位可能面临的后果
如果用人单位未按时足额缴纳社保费，根据《社会保险法》的相关规定，单位将被责令限期缴纳或补足，并按日加收万分之五的滞纳金。逾期仍不缴纳的，还可能面临欠缴数额一倍以上三倍以下的罚款。此外，单位还可能因违法行为而面临法律诉讼和声誉损失。
五、特殊情况说明
需要注意的是，社保基数有时可能受到地区政策的影响，存在上下限的规定。因此，在维权之前，建议您先与公司的人力资源部门沟通，了解具体情况，并核实是否符合当地法律法规。如果确实存在问题，再依法采取相应措施维护自己的合法权益。
综上所述，工资一万多而社保基数五千是不合法的。您应当了解自己的权益，并采取适当措施来维护自己的合法权益。希望以上解答能对您有所帮助。