主管故意考核违法，如果这种考核导致了员工绩效工资的克扣，且没有合理依据，那么这种行为是违法的。下面我从几个方面来详细解释这个问题：

1. 绩效考核与工资关系：

   • 绩效考核是现代企业管理中常用的一种激励机制，它通过与员工的工作效率、工作成果等挂钩，来激发员工的工作积极性。
   • 绩效工资作为劳动报酬的重要组成部分，其发放应基于公平、合理的考核标准。

2. 主管故意考核低分的法律后果：

   • 如果主管出于个人偏见、报复或其他非工作相关因素，故意给员工打低分，这种行为就损害了员工的合法权益。
   • 在缺乏合理考核依据的情况下，故意打低分并据此克扣员工绩效工资，违反了劳动法的相关规定，属于克扣劳动者工资的行为。

3. 法律依据：

   • 根据劳动法的相关规定，用人单位应当按时足额支付劳动者的工资报酬，不得无故克扣或拖欠。
   • 绩效工资作为工资的一部分，也应遵循这一原则。如果用人单位不能提供充分的证据证明绩效考核结果的合理性，那么员工有权要求支付被克扣的绩效工资。

4. 实际案例：

   • 以苏州市吴中区人民法院的一个案例为例，某培训公司因部门负责人与公司经理之间的矛盾，故意给劳动者绩效考核打低分，并据此少发或不发绩效工资。最终，法院支持了劳动者的诉求，判决公司支付拖欠的绩效工资。

综上所述，主管故意考核并据此克扣员工绩效工资是违法的。员工在面对这种情况时，可以依法维护自己的合法权益，要求用人单位提供合理的考核依据，并按时足额支付工资。如果用人单位拒绝改正，员工可以向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。