用人单位不能通过申请司法认定来推翻工伤认定。在我国，工伤认定是由社会保险行政部门负责的，其作出的工伤认定结论具有法律效力。如果用人单位对工伤认定结论不服，可以在收到认定结论之日起一定期限内（如60日内）申请行政复议，或者在六个月内直接提起行政诉讼。这是用人单位对工伤认定结论提出异议的法定途径。

在具体操作中，用人单位如果认为工伤认定的等级有问题，首先需要仔细审查工伤认定决定书，了解认定的具体内容和依据。如果确实存在错误或者不合理之处，用人单位可以准备相关证据材料，通过行政复议或者行政诉讼的方式提出异议。

需要注意的是，行政复议和行政诉讼都是有严格程序和时间要求的。用人单位必须在法定期限内提出申请，并按照规定的程序和要求提交相关证据材料。如果错过了法定期限或者没有按照程序要求提出申请，那么用人单位的异议可能就不会被受理。

因此，用人单位在收到工伤认定结论后，应该及时咨询专业律师或者法律顾问，了解自己的权利和义务，以及提出异议的具体程序和要求。如果有任何疑问或者不清楚的地方，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况给出专业的法律建议和指导。