针对您提出的“劳务派遣单位违法由注册地还是用工单位处理”的问题，这实际上涉及到劳务派遣违法行为的监管与处罚责任主体。以下是对此问题的详细解答：
一、劳务派遣违法行为的处理原则
劳务派遣违法行为的处理，主要遵循“谁违法，谁负责”的原则，并依据违法行为的性质和严重程度，由相应的监管部门或司法机关进行处罚。
二、劳务派遣违法行为的监管主体
劳动行政部门：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》及《劳务派遣行政许可实施办法》等相关法律法规，劳动行政部门是劳务派遣违法行为的主要监管主体。
- 劳动行政部门有权对劳务派遣单位和用工单位遵守劳务派遣规定的情况进行全面检查，包括劳务派遣单位的设立条件、劳务派遣协议的签订与执行、被派遣劳动者的劳动报酬、社会保险等权益的保障情况等。
- 对于违反劳务派遣规定的单位，劳动行政部门可依法实施行政处罚，如责令改正、罚款以及吊销劳务派遣业务经营许可证等。
司法机关：
- 当劳务派遣过程中的违法行为涉嫌犯罪时，司法机关将依法介入处理。
- 公安机关负责立案侦查涉嫌诈骗、恶意拖欠劳动报酬且情节严重的劳务派遣违法行为。
- 人民检察院对公安机关侦查结束的案件进行审查起诉，决定是否提起公诉。
- 人民法院则依法审理人民检察院提起公诉的劳务派遣犯罪案件，并作出判决。
三、劳务派遣单位违法的处理
注册地与用工单位所在地的关系：
- 劳务派遣单位违法时，首先由注册地的劳动行政部门进行监管和处罚。
- 如果违法行为发生在用工单位所在地，且涉及用工单位的责任，那么用工单位所在地的劳动行政部门也可能参与监管和处罚。
- 在某些情况下，如违法行为涉及多个地区或情节特别严重，上级劳动行政部门或相关部门也可能进行联合执法或特别处理。
具体处理流程：
- 劳动行政部门在发现劳务派遣单位违法后，会进行调查取证，并根据违法行为的性质和严重程度作出相应的行政处罚决定。
- 如果违法行为涉嫌犯罪，劳动行政部门会将案件移送公安机关进行立案侦查。
- 公安机关侦查结束后，认为需要追究刑事责任的案件会移送人民检察院进行审查起诉。
- 人民检察院审查起诉后，将案件移送人民法院进行审理和判决。
四、结论
综上所述，劳务派遣单位违法时，主要由注册地的劳动行政部门进行监管和处罚。但如果违法行为涉及用工单位或发生在用工单位所在地，且用工单位有责任，那么用工单位所在地的劳动行政部门也可能参与处理。在违法行为涉嫌犯罪的情况下，司法机关将依法介入处理。因此，劳务派遣单位违法的处理并非单一由注册地或用工单位决定，而是根据违法行为的性质和严重程度，由相应的监管部门或司法机关进行处罚。