劳动者借支备用金不还，用人单位不能直接扣抵工资。下面我将从法律角度和实际操作两个方面进行详细解释：

法律角度

1. 无直接法律依据：我国劳动法及相关法规并未明确规定用人单位可以直接从劳动者工资中扣除未归还的备用金。因此，直接扣抵工资可能缺乏法律依据。

2. 需遵循法定程序：如果用人单位想要追回未归还的备用金，应当通过合法途径，如与劳动者协商、提起民事诉讼等方式进行，而不能直接扣抵工资。

实际操作

1. 制定规章制度：用人单位可以在规章制度中明确规定备用金的借支、报销及归还流程，并明确若劳动者未按时归还备用金，用人单位有权采取相应措施（如提起民事诉讼）进行追回。但规章制度需经过民主程序制定，并向劳动者公示。

2. 协商处理：在劳动者未归还备用金的情况下，用人单位可以与劳动者进行协商，要求其归还备用金。如果劳动者同意，可以签订书面协议，明确归还金额、时间及方式等。

3. 提起民事诉讼：如果协商无果，用人单位可以向人民法院提起民事诉讼，要求劳动者归还备用金。在诉讼过程中，用人单位需要提供充分的证据证明劳动者借支了备用金且未归还。

注意事项

1. 避免违法扣薪：用人单位在处理劳动者未归还备用金的问题时，应避免直接扣抵工资，以免构成违法扣薪，引发劳动争议。

2. 及时采取措施：用人单位应及时发现并处理劳动者未归还备用金的问题，以免因拖延而导致问题复杂化或超过诉讼时效。

综上所述，劳动者借支备用金不还时，用人单位不能直接扣抵工资。而应通过合法途径进行追回，并遵循相关法律法规及规章制度的规定。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。