单位停公积金是否合法，主要取决于具体的法律法规以及单位与员工的合同约定。从一般情况来看，单位不能随意停止为员工缴存公积金。

首先，根据《住房公积金管理条例》以及多地（如长沙、贵阳等）的相关管理办法，单位有义务为员工办理住房公积金缴存登记，并为员工设立住房公积金账户。如果单位不办理住房公积金缴存登记或者不为本单位职工办理住房公积金账户设立手续，将面临一定的法律责任，包括但不限于罚款、被责令限期办理等。

具体来说，如果单位违反规定不办理住房公积金缴存登记，或者不为职工办理住房公积金账户设立手续，并且经过住房公积金管理中心的责令限期办理后仍未办理，那么单位将面临1万元以上5万元以下的罚款。这一规定旨在保障员工的住房权益，确保单位能够履行其法定义务。

此外，单位与员工之间签订的劳动合同或相关协议中，也可能对公积金的缴存进行了明确约定。如果单位擅自停止缴存公积金，可能构成对合同的违约，需要承担相应的法律责任。

综上所述，单位停公积金一般是不合法的。单位应当遵守相关法律法规和合同约定，为员工按时足额缴存公积金。如果单位存在停缴公积金的情况，员工可以向相关部门投诉举报，以维护自己的合法权益。