如果你自己去做了工伤认定，而公司之后给你打电话，你可以按照以下方式处理：
首先，保持冷静并明确态度：
- 接听电话时，保持冷静和礼貌，不要因情绪激动而说出不利于自己的话。
- 明确告知公司，你已经自行申请了工伤认定，并简要说明原因，比如公司未及时为你申请等。
其次，了解公司意图并应对：
如果公司表示支持或询问情况：
- 你可以简要说明工伤认定的进展和你的情况，但无需透露过多细节，以免后续产生不必要的纠纷。
- 询问公司是否需要你提供任何材料或协助，以表现出你的合作态度。
如果公司表示反对或质疑：
- 坚定你的立场，说明你有权自行申请工伤认定，并且这是你的合法权益。
- 对于公司的质疑，你可以礼貌地要求他们提供具体的证据或理由，并表示你会根据事实和法律来维护自己的权益。
最后，做好后续准备：
- 保留证据：确保你保留了所有与工伤相关的证据，如医疗记录、事故报告、工伤认定申请书等。
- 关注进展：及时关注工伤认定的进展，并准备好应对可能出现的任何情况。
- 寻求帮助：如果你在处理过程中遇到任何问题或困难，可以向我咨询，我会为你提供专业的法律建议和支持。
总之，你自己去申请工伤认定是合法的，无需担心公司的反应。只要保持冷静、明确态度，并做好后续准备，你就能有效地应对公司可能提出的任何问题或质疑。