将三室两厅房屋改成五间公寓出租，在大多数情况下是违法的。具体分析如下：

1. 法律依据：

   • 根据《商品房屋租赁管理办法》第六条，属于违法建筑的、不符合安全、防灾等工程建设强制性标准的、违反规定改变房屋使用性质的房屋，不得出租。将三室两厅改成五间公寓，往往涉及对房屋结构的改动，可能违反建筑安全标准和消防要求，因此属于违法出租。

2. 改造过程中的风险：

   • 若在改造过程中未对房屋主体结构进行拆改，仅在不违反消防、安全等相关规定的前提下合理利用空间进行隔断，理论上可能不违法。但实际上，这样的改造很难满足所有安全标准和法规要求。
   • 若改造涉及拆改房屋主体结构或承重结构，则明确违反了《建设工程质量管理条例》，将面临高额罚款。

3. 出租要求：

   • 出租居住房屋时，应以一间按照住宅设计规范设计为居住空间的卧室或者起居室（厅）为小出租单位，不得分隔搭建后出租。这意味着，将三室两厅改成五间公寓出租，很可能违反了这一规定。

4. 法律后果：

   • 违法出租的房屋可能会面临被相关部门责令改正、罚款等处罚。
   • 如果改造导致房屋存在安全隐患，一旦发生事故，房东可能需要承担严重的法律责任。

综上所述，将三室两厅房屋改成五间公寓出租，在大多数情况下是违法的，且存在诸多风险和法律后果。建议房东在出租房屋前，务必了解并遵守相关法律法规，确保房屋的安全性和合法性。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律咨询，可以直接向我提问。