公司职工侵占公司财产的，公司仍然要发职工的工资。侵占公司财产和发工资是两回事，但公司可以向法院申请对侵占人的工资进行保全，以挽回公司的损失。
分析说明：
- 工资支付义务：公司向职工支付工资是基于劳动合同关系的存在，以及职工为公司提供了劳动这一事实。这是公司应尽的法定义务，与职工是否侵占公司财产无关。
- 侵占财产的处理：职工侵占公司财产是另一种独立的法律行为，公司可以通过法律途径追究其责任，如向法院提起诉讼，要求职工赔偿损失。但这并不影响公司支付工资的义务。
- 工资保全措施：为了防止侵占人转移财产，公司可以向法院申请对侵占人的工资进行保全。这样，在法院作出判决后，公司可以优先从保全的工资中受偿。
法律依据：
- 《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百零二条规定了财产保全的相关措施。
- 《中华人民共和国民事诉讼法》第一百条也规定了诉讼保全的相关内容。
- 《中华人民共和国刑法》第二百七十一条则对侵占罪进行了规定。
综上所述，公司不能因职工侵占公司财产而拒绝支付其工资。正确的做法是通过法律途径追究侵占人的责任，并采取必要的保全措施以挽回损失。