如违法行为人存在两个违法行为，其中一个不予处罚，另一个给予行政处罚，应分别针对不同违法行为开具法律文书，即针对不予处罚的违法行为开具《不予行政处罚决定书》，针对给予行政处罚的违法行为开具《行政处罚决定书》。具体分析如下：
一. 分别开具法律文书的必要性
根据《行政处罚法》的相关规定，对于违法行为的处理应当做到事实清楚、证据确凿、定性准确、处理恰当。当违法行为人存在两个独立的违法行为时，应分别对每个违法行为进行调查、取证和认定，并据此作出相应的处理决定。因此，需要分别开具法律文书以体现对每个违法行为的独立处理。
不予处罚的违法行为：对于不予处罚的违法行为，应开具《不予行政处罚决定书》。该文书应载明违法行为人的基本情况、违法事实、不予处罚的理由和依据，以及作出不予处罚决定的时间等内容。这既是对违法行为人的告知，也是对行政机关执法行为的记录。
给予行政处罚的违法行为：对于需要给予行政处罚的违法行为，应开具《行政处罚决定书》。该文书应详细载明违法行为人的基本情况、违法事实、处罚的种类和依据、处罚的履行方式和期限、不服处罚决定的救济途径和期限等内容。这是行政处罚的正式文书，具有法律效力。
二. 开具法律文书的具体操作
在开具法律文书时，应注意以下几点：
准确填写文书内容：确保文书中的各项内容准确无误，特别是违法行为人的基本信息、违法事实的描述、处罚决定的依据和履行方式等关键信息。
严格遵循法定程序：在开具法律文书前，应确保已经按照法定程序对违法行为进行了调查、取证和认定。文书的开具应符合相关法律法规规定的程序要求。
明确告知救济途径：在《行政处罚决定书》中，应明确告知违法行为人不服处罚决定的救济途径和期限，如申请行政复议或提起行政诉讼的权利和期限。
综上所述，对于违法行为人存在的两个违法行为，应分别开具《不予行政处罚决定书》和《行政处罚决定书》，以体现对每个违法行为的独立处理和法律效力的正式性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。