已经是长期合同，单位叫签协议是否合法，需视具体情况而定。以下是对这一问题的详细分析：

1. 协议性质与内容：

   • 如果单位要求签订的协议是对原长期合同内容的补充、修改或确认，且协议内容不违反法律法规的强制性规定，也不损害双方当事人的合法权益，那么这样的协议是合法的。
   • 如果协议内容涉及违法事项，如违反劳动法、合同法等相关法律法规，或者损害了一方当事人的合法权益（如降低工资、延长工作时间等），那么这样的协议是不合法的。

2. 双方意愿：

   • 签订协议应当是双方自愿的行为。如果单位强迫或变相强迫员工签订协议，那么这样的协议可能因违反自愿原则而被认定为无效。
   • 员工在签订协议前，应当仔细阅读协议内容，了解协议条款的含义和后果，并有权对协议内容提出异议或进行修改。

3. 法律后果：

   • 如果协议内容合法且双方自愿签订，那么协议将具有法律效力，双方应当按照协议内容履行各自的义务。
   • 如果协议内容违法或存在强迫签订的情况，那么员工可以向有关部门投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。

综上所述，已经是长期合同的情况下，单位要求签订协议是否合法，主要取决于协议的性质与内容、双方的意愿以及法律后果等因素。如果你对协议内容有疑虑或担忧，建议咨询专业律师（即我）进行详细的法律咨询和评估。