公司和员工签订合作协议，在满足一定条件下是合法的。这些条件包括协议内容符合法律法规规定、双方意思表示真实、不存在欺诈胁迫等情形，且协议明确界定了双方的权利义务。以下是对这一问题的详细分析：

1. 协议内容的合法性：

   • 合作协议的内容必须遵守国家法律法规的强制性规定，不得违反公序良俗，也不得损害国家、社会或第三人的合法权益。
   • 协议中应明确工作成果的归属、报酬支付方式、工作职责等关键条款，以保障双方的权益。

2. 双方意思表示的真实性：

   • 合作协议的签订必须基于双方在平等、自愿的基础上真实表达自己的意愿。
   • 如果存在欺诈、胁迫等导致意思表示不真实的情形，协议可能被认定为无效或部分无效。

3. 协议形式的合规性：

   • 虽然合作协议的形式没有严格规定，但为了确保其法律效力，建议采用书面形式，并可能需要满足盖章、签字等特定形式要件。

4. 特殊情况的考虑：

   • 如果合作协议名义上是为了合作，实际上却是为了规避劳动法律法规对劳动者权益的保护，如逃避缴纳社保、加班费等义务，这样的协议可能会被判定为无效。
   • 在亲属间签署合作协议时，虽然亲属关系本身不影响协议的效力，但在解释和履行时，法院可能会综合考虑此因素，因此建议更明确地约定权利义务以避免纠纷。

综上所述，公司和员工签订合作协议在符合上述条件时是合法的。然而，为了确保协议的合法性和有效性，建议在签订前咨询专业律师进行审查，以避免潜在的法律风险与纠纷。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。