如果公司连续三个月不发工资，员工申请离职是可以获得经济补偿的。下面我为您详细解释：

法律依据

根据《劳动合同法》的相关规定：

1. 第三十八条：用人单位未及时足额支付劳动报酬的，劳动者可以解除劳动合同。这意味着，如果公司三个月不发工资，您有权主动辞职。
2. 第四十六条：劳动者依照本法第三十八条规定解除劳动合同的，用人单位应当向劳动者支付经济补偿。经济补偿的计算方式为：按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资；工作六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。

经济补偿的计算

假设您在公司工作了一年零九个月，月工资为5000元。那么，如果您因公司连续三个月不发工资而辞职，公司应支付您两个月的工资作为经济补偿，即5000元/月 × 2月 = 10000元。

维权途径

1. 协商：首先，您可以尝试与公司协商，要求支付拖欠的工资以及相应的经济补偿。
2. 投诉：如果协商无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉，由他们介入调查处理。
3. 仲裁：您还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，通过法律途径来维护自身的合法权益。在申请仲裁时，请务必准备好相关证据，如劳动合同、工资条、考勤记录等，以证明您的劳动关系和工资情况。

综上所述，如果公司连续三个月不发工资，您申请离职是可以获得经济补偿的。如果您在维权过程中遇到任何困难或疑问，都可以直接向我咨询，我会尽力为您提供帮助。