银行要求开农民工账户存保证金是合法的。这一要求的法律依据和合理性可以从以下几个方面进行阐述：
一. 法律依据
《工程建设领域农民工工资保证金规定》：根据人力资源社会保障部等七部门发布的《工程建设领域农民工工资保证金规定》，施工总承包单位应当在银行设立账户并按照工程施工合同额的一定比例存储工资保证金，专项用于支付为所承包工程提供劳动的农民工被拖欠的工资。这表明，银行要求开农民工账户存保证金是符合这一国家层面规定的。
地方实施细则：各地也根据这一规定制定了相应的实施细则，如福建省、浙江省等地的相关文件，均对农民工工资保证金的管理提出了具体要求。这些细则进一步明确了银行在农民工工资保证金管理中的角色和责任。
二. 合理性分析
保障农民工权益：农民工工资保证金制度的建立，是为了保障农民工的合法收益，防止施工总承包单位拖欠农民工工资。通过要求施工总承包单位在银行设立账户并存储保证金，可以确保在发生拖欠工资情况时，有充足的资金用于支付农民工工资。
规范市场秩序：该制度也有助于规范建筑市场秩序，促进建筑业的健康发展。通过设立工资保证金账户，可以加强对施工总承包单位的监管，督促其按时足额支付农民工工资，从而维护市场的公平竞争和良好秩序。
三. 注意事项
缴存比例和条件：根据规定，工资保证金的缴存比例原则上不低于工程施工合同额的1%，不超过3%。同时，对于同一工程地理位置涉及两个或两个以上工资保证金管理地区的，以及施工总承包单位在同一工资保证金管理地区有多个在建工程的情况，缴存比例和条件可能会有所不同。
替代方式：虽然规定要求施工总承包单位在银行设立账户并存储保证金，但同时也允许使用银行保函等替代方式。这为施工总承包单位提供了一定的灵活性，可以根据自身实际情况选择合适的缴存方式。
综上所述，银行要求开农民工账户存保证金是合法的，并且这一要求有助于保障农民工的合法权益和规范市场秩序。如有进一步需要，您可以继续咨询我。