劳动局收取农民工保证金是合法的。以下是对此问题的详细分析：

一. 法律依据

1. 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定：为了确保农民工的合法权益，特别是工资支付方面，有关部门可以依法采取一系列措施，包括但不限于收取保证金。这些措施旨在预防和解决用人单位拖欠农民工工资的问题。

2. 具体政策依据：在实际操作中，各地政府或劳动部门可能会根据当地实际情况，制定具体的政策或规定，明确保证金的收取、管理、使用及退还等流程。这些政策或规定通常是基于《劳动法》及相关法律法规的框架内制定的，因此具有合法性。

二. 保证金的作用与意义

• 保证金作为一种经济手段，可以在一定程度上约束用人单位的行为，促使其按时足额支付农民工工资。
• 当用人单位出现拖欠工资等违法行为时，保证金可以作为应急资金，用于先行垫付农民工的工资，从而保障农民工的合法权益。

三. 实际操作中的注意事项

1. 了解政策细节：农民工在缴纳保证金前，应详细了解当地政策的具体内容，包括保证金的缴纳标准、管理方式、使用条件及退还流程等。
2. 保留证据：缴纳保证金时，应妥善保管好相关凭证和证据，以便在需要时能够证明自己的权益。

综上所述，劳动局收取农民工保证金是合法的，并且这一措施在保障农民工合法权益方面具有重要意义。如有进一步需要，您可以继续咨询我。