未完成的工程应当扣减相应工程价款。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 合同法的相关规定

1. 合同履行与违约：根据《合同法》的相关规定，当事人应当按照约定全面履行自己的义务。如果一方未按照合同约定完成工程，即构成违约，应当承担相应的违约责任。
2. 质量不符合约定：同时，《合同法》还规定，如果工作成果的质量不符合质量要求，定作人可以合理选择请求承揽人承担修理、重作、减少报酬、赔偿损失等违约责任。

二. 建设工程合同的特殊性

1. 工程未完工的界定：在建设工程合同中，工程未完工通常指的是承包人未按照合同约定的工期或质量标准完成全部工程。
2. 擅自使用的后果：如果发包人在工程未完工的情况下擅自使用，这并不意味着其放弃了追究承包人违约责任的权利。相反，发包人仍然有权要求承包人对未完成的工程部分承担相应责任。

三. 扣减工程价款的合理性

1. 扣减的依据：基于合同法的相关规定，发包人有权根据承包人未完成的工程部分扣减相应的工程价款。这是发包人维护自身合法权益的正当手段。
2. 扣减的方式：扣减工程价款的具体方式可以依据双方合同的约定进行，如按照未完成工程部分的比例扣减，或者按照双方协商一致的金额进行扣减。

综上所述，对于未完成的工程部分，发包人有权扣减相应的工程价款。这是基于合同法的相关规定以及建设工程合同的特殊性而得出的结论。我建议在实际操作中，双方应首先尝试通过协商解决争议，如果协商不成，可以寻求法律途径来维护各自的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。